Salino3_00340 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces albus
Strain	XM211
Entry name	Salinomycin
Contig	JN033543
Start / Stop / Direction	106,029 / 108,617 / + [in whole cluster] 106,029 / 108,617 / + [in contig]
Location	106029..108617 [in whole cluster] 106029..108617 [in contig]
Type	CDS
Length	2,589 bp (862 aa)

Annotation

Category	1.2 NRPS
Product	non-ribosomal peptide synthetase
Product (GenBank)	putative peptide synthetase
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	Orf13
Reference	ACC H6D590 PmId [22156425] Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. (Appl Environ Microbiol. , 2012) comment polyetherに特異的なepoxidaseの配列に基づいた縮重プライマーを用いて、Streptomyces albus XM211からsalinomycin(sln)生合成gene clusterを同定。 Orf13 (862aa) : Peptide synthetase orf13を置換により不活化してもsalinomycin生産性に変化なし。
Related Reference	ACC H1ZZV4 NITE Salino_01120 PmId [22076845] A late-stage intermediate in salinomycin biosynthesis is revealed by specific mutation in the biosynthetic gene cluster. (Chembiochem. , 2012) comment Streptomyces albus subsp. albus_salX Putative non-ribosomal peptide synthetase domains C, PCP position 558までは[H6D590]と配列が完全一致。 position 559以降は相同性なし、C末足りない。 --- [PMID: 22076845] monC gene-based hybridisation probeを使ってsalinomycin(sal)生合成gene clusterを同定。 salX (597aa): non-ribosomal peptide synthase C, PCP monensinなどのpolyether生合成では、discrete KS (KSX)が最終moduleの終末ACPに特異的に結合し、完全長polyketide鎖をdiscrete ACP (ACPX)へ移し、そこでoxidative cyclisationが起こることが報告されている。 sal clusterにおけるKSX候補は、PKSのC末ACPにfusionしている(SalAIX)。 ACPX候補はSalXである。SalXのN末に見られるNRPSの典型的なC domainは、active site His138がArgによって置換されており縮合活性がないようだ。

Sequence

>non-ribosomal peptide synthetase [putative peptide synthetase]
MIPLSHAQNRLWPADRLGTGHEACHLPLVLRHSGPLDVRALRLALTDLVARHEILRTVFP
ERAGVPYQQILTEAPLPLPVEESGEERLTEDLRRVSAEPFDLRTGIPLRAHLFSLPGGSH
VLLVVLHRIAADEDSLSLLLTGLREAYAARREGAPPSWKPLPVQYADFALWQREVLGDLR
DPDSLLSRQLGEWSTALAGLPQRLTLPADRPGPARWESPAGCVRFKVGAALHRDLLDLGR
GSRATLFMVLHAALAALLTSLGAGEDIPVGSPVTGRADEVLEGVVGCFTNTLVIRSDTAD
KPSFRELLARVRERVLFAYAHGDVPFDLLAEEIAPASAAARAPLVQVLLSLRTERAQEPA
GEPEFTREEPARRTAPAELDLAFTQRRAGDGTPQGMTAVLTYAADRFDHPTAQSLAGELH
TLLRTAVREPLPPPGTEELLGPEQRGPFATAEAEQPGSRMRRSRRERLGHRREEVAAAPG
EGPGEDLCAAAAARARPPATPLESSLCRILAEVLAVEEVEPEDDFFELGGDSLLGMRVLS
RVRARLGIELGVCALFDARPPPVSPRPSPAPSRTPPTTTSEATSRPDGSRAGRAPAPEVP
PRTSAAPRTDRGAARSLGDVRGGAPVQDEEFTAALPHGLAARLEVVVAVAAEELEPAAGV
GDEVLPLVQRVVLGRATAEDHIGLLLGLRHVRALPCADRGRNLPVRPGTAVDRDPLRGRA
PGSGGLRAGPRAPLLPRCSRVRSPRIRGPTAVKGPRVLTRTAPRPSGPPRADMAPMKPWP
AKVRPASHFRTADTGERGGPAARKLSRSVAQWFRVPSPRGSVSQRWVQSGHWRKTLGPLL
LSRYCQCRVQLRPAPQVPQSAP

>non-ribosomal peptide synthetase [putative peptide synthetase]
GTGATCCCGCTGTCCCATGCCCAGAACCGGCTGTGGCCGGCTGACCGGCTGGGCACCGGC
CACGAGGCCTGCCATCTGCCGCTGGTGCTGCGGCACTCCGGCCCGCTCGACGTGCGCGCC
CTGCGCCTCGCGCTGACCGACCTCGTCGCCCGGCACGAGATCCTCCGCACCGTCTTCCCC
GAACGCGCCGGGGTGCCCTACCAGCAGATCCTCACCGAGGCCCCGCTCCCGCTGCCGGTC
GAGGAGAGCGGCGAGGAGCGGCTGACCGAGGACCTGCGGCGGGTGAGCGCCGAACCCTTC
GACCTGCGGACCGGCATCCCGCTGCGGGCCCACCTGTTCAGCCTCCCCGGCGGCAGCCAC
GTACTCCTGGTGGTGCTGCACCGCATCGCCGCCGACGAGGACTCCCTCTCCCTGCTGCTC
ACCGGGCTCCGCGAGGCGTACGCGGCCCGCCGCGAGGGCGCGCCGCCGTCCTGGAAGCCG
CTGCCGGTGCAGTACGCCGACTTCGCGCTGTGGCAGCGCGAGGTCCTCGGCGATCTGCGC
GACCCGGACAGCCTGCTCAGCCGTCAGCTCGGCGAGTGGAGCACGGCCCTCGCCGGGCTG
CCGCAGCGGCTCACCCTGCCCGCGGACCGGCCGGGGCCCGCCCGGTGGGAGAGCCCGGCG
GGCTGCGTGCGCTTCAAGGTCGGGGCCGCCCTGCACCGGGACCTCCTCGACCTGGGGCGC
GGCAGCCGGGCCACCCTCTTCATGGTGCTGCACGCAGCCCTGGCCGCCCTGCTGACCTCA
CTCGGCGCGGGCGAGGACATCCCGGTCGGCTCCCCCGTGACGGGCCGCGCCGACGAGGTC
CTCGAAGGGGTCGTCGGCTGCTTCACCAACACCCTGGTGATCCGCTCCGACACCGCCGAC
AAGCCGTCCTTCCGCGAACTGCTCGCCCGGGTCCGCGAACGCGTCCTGTTCGCCTACGCC
CACGGCGACGTCCCCTTCGACCTGCTCGCCGAGGAGATCGCCCCGGCCTCGGCCGCCGCC
CGCGCCCCGCTCGTCCAGGTCCTGCTGTCGCTGCGCACCGAACGCGCCCAGGAGCCCGCC
GGGGAACCGGAGTTCACCCGCGAGGAGCCCGCCCGCCGCACCGCCCCGGCCGAACTGGAC
CTCGCCTTCACCCAGCGCCGCGCCGGGGACGGCACCCCGCAGGGCATGACCGCGGTGCTC
ACCTACGCCGCCGACCGCTTCGACCACCCGACCGCCCAGTCCCTCGCGGGCGAGCTGCAC
ACCCTGCTGCGCACCGCCGTACGCGAGCCGCTCCCGCCGCCCGGCACCGAGGAGCTCCTC
GGCCCCGAGCAGCGCGGTCCCTTCGCCACCGCCGAGGCGGAGCAGCCCGGTTCACGGATG
CGCCGCAGCAGACGCGAGCGCCTCGGCCACCGCCGGGAGGAGGTCGCCGCGGCACCGGGG
GAGGGGCCCGGCGAGGACCTCTGCGCCGCGGCGGCGGCCCGGGCCAGGCCCCCGGCGACC
CCGCTGGAGTCGAGCCTGTGCCGGATCCTCGCCGAGGTGCTCGCCGTGGAGGAGGTGGAA
CCCGAGGACGACTTCTTCGAGCTGGGCGGGGACTCCCTGCTCGGCATGCGCGTCCTCAGC
CGGGTCCGCGCCCGGCTCGGCATCGAACTGGGCGTCTGCGCCCTCTTCGACGCCCGACCG
CCGCCGGTCTCGCCGAGGCCTTCACCCGCGCCGAGCAGGACGCCGCCGACGACGACGAGC
GAGGCGACGAGCCGCCCGGACGGCAGCCGTGCGGGGAGGGCCCCCGCGCCTGAGGTCCCT
CCCCGCACGTCGGCGGCGCCGCGGACGGACCGCGGCGCCGCCCGCTCACTCGGCGACGTA
CGTGGTGGCGCTCCAGTCCAGGACGAGGAGTTCACGGCCGCCCTGCCGCACGGTCTCGCC
GCTCGCCTCGAAGTGGTCGTAGCGGTTGCCGCGGAGGAGCTTGAACCTGCTGCCGGGGTC
GGCGACGAAGTGCTCCCGCTCGTGCAGCGGGTAGTTCTCGGCCGGGCCACCGCGGAGGAT
CACATTGGTCTGCTGCTCGGACTGCGTCATGTGCGGGCGCTCCCTTGTGCGGATCGGGGT
CGGAACCTGCCGGTCCGCCCCGGCACCGCGGTGGACCGCGACCCGCTCCGGGGCCGCGCG
CCCGGCTCCGGTGGCCTGCGCGCCGGCCCGCGCGCACCTCTGTTGCCGCGGTGCTCGCGA
GTCCGGTCCCCTCGGATCCGGGGCCCGACGGCCGTGAAGGGTCCGCGCGTGCTCACGCGG
ACCGCGCCCCGGCCGTCCGGCCCGCCCCGGGCGGACATGGCACCGATGAAGCCATGGCCC
GCTAAAGTGCGGCCTGCGTCACACTTCCGTACGGCGGACACCGGTGAGCGGGGAGGTCCC
GCGGCTCGGAAGCTCAGTCGCTCAGTCGCTCAGTGGTTCCGGGTGCCGTCTCCGCGCGGG
TCGGTGTCCCAGAGGTGGGTGCAGTCGGGGCACTGGAGGAAGACCCTCGGGCCCTTGTTG
CTCAGCAGGTACTGCCAGTGCCGGGTGCAGCTGCGGCCCGCGCCGCAGGTACCGCAGTCC
GCGCCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001242 Condensation domain (Domain) PF00668 Condensation IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM) PS00012 PHOSPHOPANTETHEINE IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain) SSF47336 ACP_like G3DSA:1.10.1200.10 ACP_like PS50075 ACP_DOMAIN PF00550 PP-binding
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Salino3_00330 Salino3_00350