Pier_00080 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces piomogenus var. Hangzhouwanensis
Strain
Entry name	Piericidin
Contig	HQ840721
Start / Stop / Direction	43,672 / 44,358 / + [in whole cluster] 43,672 / 44,358 / + [in contig]
Location	43672..44358 [in whole cluster] 43672..44358 [in contig]
Type	CDS
Length	687 bp (228 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	putative O-methyltransferase
Product (GenBank)	PieB1
Gene	pieB1
Gene (GenBank)
EC number	2.1.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)	methyltransferase
Reference	ACC H8XZR4 PmId [22365607] Elucidation of Piericidin A1 biosynthetic locus revealed a thioesterase-dependent mechanism of alpha-pyridone ring formation. (Chem Biol. , 2012) comment Piericidin A1生合成gene clusterの報告。 PieB1: Methyltransferase homolog: O-methyl transferase [Streptomyces thioluteus] 17kb fragment(pieA4-B2)を置換したdeletion mutantはPiericidin A1の産生を完全に廃止した。配列解析から、2つのO-methyltransferase PieB1, PieB2がPiericidin A1のtailoringに関与するとしている。
Related Reference	ACC Q70KH3 NITE Aureo_00090 PmId [16292785] Dissection of the late steps in aureothin biosynthesis. (Chembiochem. , 2006) comment Blast id58% Streptomyces thioluteus_aurI O-methyl transferase Aureothin生合成遺伝子不活化、相補、生物変換実験により、furan環形成に先立って、最後から2番目の生合成ステップとしてgamma-pyrone methylationが起こることがわかっている。また、AurI がO-methyltransferaseとして同定され、aureothin polyketide前駆体にmethionine由来methyl unitを位置特異的に導入し、methyl化されたgamma-pyrone環を得る。
	ACC Q2P9Z9 NITE Stref_00160 PmId [16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) comment Blast id38% Streptomyces steffisburgensis_stfMI O-methyl transferase Steffimycin生合成遺伝子 stfMIが不完全だと2-hydroxy基のO-methylationがされていない化合物が検出される。
	ACC Q9KHK8 NITE Enter_00070 PmId [11893195] Mutational analysis of the enterocin favorskii biosynthetic rearrangement. (Org Lett. , 2002) [15505225] EncM, a versatile enterocin biosynthetic enzyme involved in Favorskii oxidative rearrangement, aldol condensation, and heterocycle-forming reactions. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2004) comment Blast id40% Streptomyces maritimus_encK Putative O-methyl transferase EncK Enterocin生合成遺伝子 --- [PMID:11893195](2002) abstract S.maritimusのenterocin生合成に関わるencMおよびencKの解析。どちらのmutantもenterocin産生が停止し、nonrearranged-、nonmethylated polyketideが蓄積。これまでは、EncMがFavorskii-like rearrangement、EncKがO-methylationを触媒していると考えられていたが、どちらのproductもFavorskii-like rearrangementに関与していることが示された。特に、EncMについては、その役割から"favorskiiase"とも呼ばれるようである。 --- [PMID:15505225](2004) Favorskii-like rearrangementに関与するのがEncM単独であるとわかったのでEncKについて再検討したところ、発酵条件が影響していたことが判明。異種性に発現したencABCLMN/encDでFavorskii-like rearrangement済のdesmethyl-5-deoxyenterocinを検出。encABCLMN/encDKで5-deoxyenterocinを検出。よってEncKは desmethyl-5-deoxyenterocin → 5-deoxyenterocinを担う。このメチル化はenterocin生合成において最後から2番目のステップである。 pyrone環を持っているbicyclic polyketidesはvivoでメチル化されないので、EncKはenterocinのpyrone環のために特異的であるようだ。
	ACC W0CAB5 PmId [24409990] ( , ) comment BLAST id67% Streptomyces sp. SCSIO 03032 PieB1 深海由来Streptomyces sp. SCSIO 03032からpiericidin A1 gene clusterを同定。 in vivo and in vitro実験で、4'-hydroxylaseとしてPieEが、4'-O-methyltransferaseとしてPieB2が検証され、これによってpiericidin A1生合成に関与するPKS後修飾段階が解明された。 3つの異なる株由来のpiericidin A1 gene clustersにはそれぞれ、methyltransferaseをコードする遺伝子が2つずつある(pieB1, pieB2)。 pieB1不活化株ではpiericidin A1に関連する化合物を検出しない。 pieB2不活化株では化合物 4 (4'-O-demethyl-piericidin A1)を産生した。 pieB1 and pieB2をクローニングして可溶性タンパクとして精製し、in vitro assayに使用した。 PieB2はSAM存在下で化合物 4をpiericidin A1へと変換したが、PieB1ではできなかった。よって、PieB2がpiericidin A1生合成を仕立てる特異的な4'-O-methyltransferaseであると確認された。 PieB1のin vitro assayは推定基質を欠くためにできていないが、pieB1不活化株ではpiericidin A1産生がなくなることから、PieB1はその生合成に関与し、おそらく5'-O-methyl基形成を担う。

Sequence

>putative O-methyltransferase [PieB1]
MSIDNDHQPGSVDQAVLDGANPYHRRALAFYDLLVFRGSAPLFWRCSPRNFLEMYRTSIG
AKHLEIGVGTGYLLQRTRFPVSNPEITLADLNPSTLDFTAERLAHFKTTKVVANALEPLP
VPAESHDSAALSFLLHCIPGSLREKGVAIRHAAAAVRPGGTVFGSTILSQGVPVTGAGRW
LMNDLNGKGVFHNDQDHLDDLRDQLKQNFDDFDLAVRGCVALWRARKS

>putative O-methyltransferase [PieB1]
ATGAGCATCGACAACGACCACCAGCCCGGCTCCGTCGACCAGGCGGTCCTGGACGGCGCG
AACCCGTACCACCGGCGCGCGCTCGCCTTCTACGACCTGCTCGTCTTCCGCGGCAGCGCA
CCGCTGTTCTGGCGCTGCTCCCCGCGCAACTTCCTGGAGATGTACCGGACCTCCATCGGC
GCCAAGCACCTGGAGATCGGCGTCGGCACCGGCTACCTGCTGCAGCGCACCCGGTTCCCG
GTCTCGAACCCGGAGATCACGCTGGCCGACCTCAACCCCAGCACCCTCGACTTCACCGCC
GAGCGGCTGGCGCACTTCAAGACCACCAAGGTGGTCGCCAACGCGCTGGAGCCGCTGCCG
GTGCCCGCCGAGAGCCACGACTCGGCCGCCCTCAGCTTCCTGCTGCACTGCATCCCCGGC
AGCCTGCGCGAGAAGGGCGTCGCCATCCGGCACGCCGCGGCGGCCGTGCGGCCCGGCGGC
ACGGTGTTCGGCAGCACGATCCTCTCCCAGGGCGTCCCGGTCACCGGGGCCGGCCGCTGG
CTGATGAACGACCTCAACGGCAAGGGTGTCTTCCACAACGACCAGGACCACCTGGACGAC
CTGCGCGACCAGCTGAAGCAGAACTTCGACGACTTCGACCTGGCCGTGCGCGGCTGCGTC
GCCCTGTGGCGGGCCCGCAAGTCGTAA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR013217 Methyltransferase type 12 (Domain) PF08242 Methyltransf_12 IPR016584 S-adenosyl-L-methionine dependent methyltransferase, YbcY, predicted (Family) PIRSF011491 Mtase_YbcY_prd
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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