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A4092_00290 : CDS information

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Organism
StrainATCC 39727
Entry nameA40926
Contig
Start / Stop / Direction52,557 / 50,428 / - [in whole cluster]
52,557 / 50,428 / - [in contig]
Locationcomplement(50428..52557) [in whole cluster]
complement(50428..52557) [in contig]
TypeCDS
Length2,130 bp (709 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
ProductD-mannose C-6' O-acetyltransferase
Product (GenBank)putative acyltransferase
Gene
Gene (GenBank)dbv23
EC number2.3.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[12837387] The gene cluster for the biosynthesis of the glycopeptide antibiotic A40926 by nonomuraea species. (Chem Biol. , 2003)
[17873036] Phosphate-controlled regulator for the biosynthesis of the dalbavancin precursor A40926. (J Bacteriol. , 2007)
[20414653] Improved production of A40926 by Nonomuraea sp. through deletion of a pathway-specific acetyltransferase. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2010)
comment
[PMID: 12837387](2003)
Nonomuraea sp. ATCC39727由来A40926生合成gene clusterの同定論文。
A40926は半合成グリコペプチドdalbavancin (BI397 or MDL 62,397)の前駆体。

dbv ORF23: acyltransferase

配列解析のみ。グルコサミン部分のN-アシル化に関与するかもしれない。

---
[PMID: 17873036](2007)
RT-PCRとその産物のシークエンスで、dbv23-dbv22が同時転写されることを確認。
リン酸による遺伝子発現への影響がRT-PCR と real-time RT-PCRで調査されている。dbv22は影響を受けない。

---
[PMID: 20414653](2010)
誘導体合成の基質となることから、mannose部分のposition 6でO-結合アセチル基を持たないグリコペプチド（化合物２）がA40926として扱われているが、実際にはアセチル化されたmannoseを持つもの（化合物１）が主に産生される最終産物であり、A40926はこれらグリコペプチドの複合体である。

dbv23 deletion mutantは化合物２のみを産生する。よってDbv23はmannoseにアセチル基を付加することを担う。Dbv23の基質は、化合物２もしくはaglyconeに付加する前のmannoseである。

また、mutant株では化合物２の産生性が2倍になるが、化合物１の添加で抑制される。この抑制効果にdbv22が関与するかもしれないと述べている。

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selected fasta
>D-mannose C-6' O-acetyltransferase [putative acyltransferase]
MSLPTCACGLTPHAPSCAPRSEHAGGRSSESRTDIQGLRAIAVAAVVAFHLWPGGPTGGY
VGVDVFFVISGYLITSHLLRQPGHGGGRLLDFWARRVRRLIPAASLALLVTLAASVVWLP
LTVLGTAAREVIAATVYVENLRLALTQANYLDVDQPDWPAQHYWSLSIEEQFYLGWPLLL
GSAAWLAARVARGRRPPENFTRWSAVVVTGAVVAASLAWSVQKTATDPAAAYFVSTTRFW
ELALGGLLAAVLTVRAMPRARAVRAGLAWAGLGMIGWAVVRFDAETAFPGAAALVPTVGA
CLVIAAAADGLRGGPGRALAWRPVQWLGNASYAVYLWHWPPIMILPYALGRSLTVIESVG
VIALTLVLAALSQYLVEDRLRWHPVLVRSRRLTFAMLASCVVVVAGAGAGVVAYADAAER
TESAAFEAAASRAGSCLGAGVVRDPACQDLGLLMPPQVALKDKPAVYADGCVNKEPFIAR
NTCTYGPDAAGRRIALVGNSHAGHWVPALEKALWSERWQLTTYVQLACYTVDQPLVLEGA
GVSENCQKINKWAVGSIVNGGYDLVIMSNRTHVPLAGVSPAGQQAAAERAYRDTLRAFTG
AGLPVLVLRDTPAMPDSVPHCIAKHPDDLDSCGGPAGVVLRPDPLAAAARADDTGLVSVA
SVDHLVCGERCGPVIGGLIAYSDRSHLTTTFARTLAPEVTAAVRGALTR
selected fasta
>D-mannose C-6' O-acetyltransferase [putative acyltransferase]
ATGTCCCTTCCGACCTGCGCATGCGGGCTGACGCCGCACGCCCCGTCGTGTGCGCCGCGA
AGCGAGCACGCCGGCGGCCGGAGCTCCGAGTCCCGCACGGACATTCAGGGCCTCCGGGCG
ATCGCGGTGGCGGCGGTGGTCGCGTTCCACCTGTGGCCCGGCGGGCCGACCGGCGGGTAC
GTGGGGGTAGACGTCTTCTTCGTCATCTCCGGGTACCTCATCACGAGCCACCTGCTGCGT
CAGCCGGGACACGGCGGCGGGAGACTGCTGGACTTCTGGGCACGCCGCGTCCGCCGCCTC
ATCCCGGCCGCGAGCCTCGCGCTCCTGGTCACGCTCGCCGCGTCGGTGGTCTGGCTGCCG
CTCACGGTGCTGGGGACGGCGGCGCGTGAGGTGATCGCCGCCACGGTGTACGTGGAGAAC
CTGAGACTCGCGCTCACGCAGGCGAACTACCTCGACGTCGACCAGCCGGACTGGCCCGCG
CAGCACTACTGGTCGCTGTCCATCGAGGAACAGTTCTACCTCGGCTGGCCGCTGCTGCTG
GGGTCGGCGGCCTGGCTGGCCGCCCGGGTGGCACGGGGGCGTCGCCCTCCGGAGAACTTC
ACGAGGTGGAGCGCGGTGGTGGTCACGGGTGCGGTCGTGGCCGCGTCCCTCGCCTGGTCG
GTGCAGAAGACGGCGACCGATCCGGCCGCCGCGTACTTCGTGTCGACGACCCGCTTCTGG
GAGCTCGCGCTCGGCGGTCTGCTCGCCGCGGTTCTCACCGTACGCGCGATGCCGCGCGCG
CGGGCGGTCCGGGCCGGGCTCGCGTGGGCCGGCCTGGGCATGATCGGGTGGGCCGTGGTC
CGGTTCGACGCCGAGACGGCCTTCCCCGGAGCCGCCGCCCTGGTGCCGACAGTGGGGGCC
TGCCTGGTGATCGCAGCGGCCGCGGACGGTCTGCGCGGCGGACCCGGGCGGGCGCTGGCG
TGGCGGCCGGTCCAGTGGCTCGGCAACGCCTCCTACGCGGTGTACCTGTGGCATTGGCCG
CCGATCATGATCCTCCCGTACGCGCTGGGCCGCTCGCTGACCGTGATCGAGTCCGTGGGC
GTGATCGCGCTGACCCTGGTCCTCGCCGCGCTCTCGCAGTACCTCGTCGAGGACCGGCTG
CGCTGGCACCCGGTCCTGGTCCGCAGCCGCAGGCTCACGTTCGCGATGCTCGCGTCGTGC
GTGGTGGTCGTCGCAGGAGCGGGAGCGGGCGTCGTCGCCTACGCCGACGCCGCCGAGCGT
ACGGAGAGTGCCGCGTTCGAGGCCGCGGCCTCGCGGGCAGGGTCATGCCTGGGTGCCGGC
GTCGTGCGCGACCCGGCGTGCCAGGATCTGGGCCTGCTGATGCCTCCTCAGGTCGCGTTG
AAGGACAAGCCCGCCGTGTACGCGGACGGGTGCGTGAACAAGGAACCGTTCATCGCCCGG
AACACGTGCACGTACGGACCTGACGCCGCCGGCAGGCGCATCGCCCTGGTCGGGAACTCC
CACGCGGGACACTGGGTCCCGGCCCTGGAGAAGGCGCTGTGGAGCGAGCGCTGGCAGCTC
ACCACCTACGTACAGCTGGCGTGCTACACCGTCGATCAGCCGCTCGTCCTCGAAGGCGCG
GGGGTCTCGGAGAACTGCCAGAAGATCAACAAGTGGGCGGTCGGGTCCATCGTGAACGGC
GGCTACGACCTGGTGATCATGTCCAACCGTACGCATGTGCCGCTCGCCGGCGTCTCGCCA
GCCGGCCAGCAGGCCGCGGCCGAGCGGGCCTACCGCGACACGCTCCGGGCCTTCACCGGC
GCCGGCCTTCCGGTGCTCGTCCTGCGTGACACCCCGGCCATGCCGGACAGCGTGCCCCAC
TGCATCGCCAAGCACCCGGACGATCTGGACTCCTGCGGCGGCCCGGCCGGCGTCGTGCTC
CGGCCGGATCCGCTCGCCGCCGCCGCCCGCGCCGACGACACCGGCCTCGTCTCCGTGGCG
AGTGTCGATCACCTGGTGTGCGGCGAGCGGTGCGGCCCCGTCATCGGCGGCCTGATCGCC
TACTCCGACCGCAGCCACCTCACCACCACCTTCGCCCGCACCCTGGCGCCCGAGGTCACG
GCAGCGGTGCGCGGTGCGCTGACTCGGTAG

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002656 Acyltransferase 3 (Domain)
[33-370] 1.5e-25 PF01757
PF01757   Acyl_transf_3
SignalP No significant hit
TMHMM
[57-79] Transmembrane (o-i) [100-122] Transmembrane (i-o) [172-191] Transmembrane (o-i) [203-220] Transmembrane (i-o) [230-252] Transmembrane (o-i) [265-282] Transmembrane (i-o) [292-314] Transmembrane (o-i) [327-349] Transmembrane (i-o) [354-376] Transmembrane (o-i) [392-414] Transmembrane (i-o)
Transmembrane 10   
A4092_00280 A4092_00280   A4092_00300 A4092_00300
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