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微生物 : Lactobacillus acidipiscis

微生物株情報

NBRC番号 102164
学名 Lactobacillus acidipiscis
別名（シノニム） Lactobacillus cypricasei
由来 JCM 11551 <- CIP 106393 <- CCUG 42961 <- P.A. Lawson, LMK3
他保存機関番号 ATCC BAA-288=CCUG 42961=CIP 106393=DSM 15353=JCM 11551=KCTC 13900
他株番号 LMK3
参考文献
11211271
Lactobacillus cypricasei sp. nov., isolated from Halloumi cheese. (Int J Syst Evol Microbiol. 2001)
16825650
Lactobacillus cypricasei Lawson et al. 2001 is a later heterotypic synonym of Lactobacillus acidipiscis Tanasupawat et al. 2000. (Int J Syst Evol Microbiol. 2006)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLaciK1_010100010736
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLaciK1_010100005884
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseLaciK1_010100009451
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinLaciK1_010100009114
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinLaciK1_010100011297
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinLaciK1_010100009981 LaciK1_010100009971
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinLaciK1_010100002062 LaciK1_010100009966

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA80675
ローカスタグLaciK1
INSDC entriesNZ_BACS01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数487
サイズ(bp) 2,286,440
遺伝子数 4,353
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度23x
シーケンス方法
  • Roche 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
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