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微生物 : Thermobispora bispora

微生物株情報

NBRC番号 14880
学名 Thermobispora bispora
別名（シノニム） Microbispora bispora
由来 IFO 14880 <- Meiji Seika Kaisha, Ltd. (S. Miyadoh) <- ATCC 19993 <- A. Henssen, R51
他保存機関番号 ATCC 19993=CBS 139.67=DSM 43833=JCM 10125
他株番号
参考文献
8863419
A proposal to transfer Microbispora bispora (Lechevalier 1965) to a new genus, Thermobispora gen. nov., as Thermobispora bispora comb. nov. (Int J Syst Bacteriol. 1996)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseTbis_0609
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須C
APH7
(NRULE_0157)
Hygromycin-B 7''-O-kinaseTbis_2343
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseTbis_0056
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ITbis_1688
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTbis_1937
Bioplastic degradation(NFUNC_0015)
必須B
PHAZ2
(NRULE_0080)
Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymeraseTbis_2633 Tbis_0780 Tbis_0388
Hygromycin resistance(NFUNC_0055)
必須A
APH7
(NRULE_0157)
Hygromycin-B 7''-O-kinaseTbis_2343
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseTbis_0187
D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseTbis_0440
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTbis_2691 Tbis_2688
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTbis_2690
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTbis_2690
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinTbis_2689
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseTbis_1374
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Tbis_1374
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDTbis_1371
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseTbis_1375
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseTbis_1372
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFTbis_1066
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseTbis_2859 Tbis_0874
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseTbis_2294
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseTbis_3304
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTbis_2069
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTbis_2067

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA20737
ローカスタグTBIS
INSDC entriesCP001874
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,189,976
遺伝子数 3,546
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Thermobispora bispora type strain (R51). (Stand Genomic Sci. 2010) PMID: 21304716

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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1.2 MB 1008.5 KB 732.9 KB 275.6 KB