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微生物 : Kytococcus sedentarius

微生物株情報

NBRC番号 15357
学名 Kytococcus sedentarius
別名（シノニム） Micrococcus sedentarius
由来 IFO 15357 <- CCM 314 <- C.E. ZoBell, 541
他保存機関番号 ATCC 14392=CCM 314=CCUG 33030=CIP 81.72=DSM 20547=JCM 11482=LMG 14228=NCIMB 555=NCTC 11040=VKM B-1316
他株番号 541
参考文献
7547287
Taxonomic dissection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesterenkonia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Dermacoccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. (Int J Syst Bacteriol. 1995)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseKsed_07450
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseKsed_09180
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseKsed_19650
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseKsed_19640
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseKsed_19660
Hydroxyectoine biosynthesis(NFUNC_0057)
必須A
ECTD
(NRULE_0189)
Ectoine hydroxylaseKsed_19670
任意 
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseKsed_19650
 
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseKsed_19640
 
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseKsed_19660
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseKsed_25620
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinKsed_20050
F
SOXR
(NRULE_0329)
Redox-sensitive transcriptional activator SoxRKsed_01270 Ksed_01780
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinKsed_20050
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinKsed_20040
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseKsed_09530
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseKsed_03840
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseKsed_03830
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterKsed_13010 Ksed_04020 Ksed_00860
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterKsed_04170
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSKsed_15370
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTKsed_15360

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA21067
ローカスタグKSED
INSDC entriesCP001686
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,785,024
遺伝子数 2,554
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Kytococcus sedentarius type strain (541). (Stand Genomic Sci. 2009) PMID: 21304632

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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