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微生物 : Rothia mucilaginosa

微生物株情報

NBRC番号 15673
学名 Rothia mucilaginosa
別名（シノニム） Stomatococcus mucilaginosus
由来 IFO 15673 <- GIFU 9911 <- ? <- T. Bergan, 5762/67
他保存機関番号 ATCC 25296=CCM 2417=CCUG 20962=CIP 71.14=DSM 20746=GIFU 9911=JCM 10910=NCTC 10663
他株番号
参考文献
10843069
Characterization of a Rothia-like organism from a mouse: description of Rothia nasimurium sp. nov. and reclassification of Stomatococcus mucilaginosus as Rothia mucilaginosa comb. nov. (Int J Syst Evol Microbiol. 2000)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseROTMU0001_0732
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseROTMU0001_1537
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IROTMU0001_0382
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseROTMU0001_1043
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinROTMU0001_0779
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinROTMU0001_0661
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinROTMU0001_0661
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterROTMU0001_0589
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSROTMU0001_0234
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTROTMU0001_0233

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA31405
ローカスタグROTMU0001
INSDC entriesACVO00000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数25
サイズ(bp) 2,255,158
遺伝子数 1,737
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度28x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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