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微生物 : Fimbriimonas ginsengisoli

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Fimbriimonas ginsengisoli
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号 Gsoil 348
他株番号 JCM 17079
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseOP10G_4077
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseOP10G_0993
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseOP10G_1236
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IOP10G_4531
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseOP10G_3014
Freeze resistance (by antifreeze protein)(NFUNC_0019)
必須A
AFP
(NRULE_0089)
Ice-structuring proteinOP10G_0441
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseOP10G_2006
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinOP10G_4391
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinOP10G_0274
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinOP10G_0274
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseOP10G_0993
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSOP10G_1471
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTOP10G_2432

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA234472
ローカスタグOP10G
INSDC entriesCP007139
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 5,231,762
遺伝子数 4,820
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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