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微生物 : Enterococcus pallens

微生物株情報

NBRC番号 100697
学名 Enterococcus pallens
別名(シノニム) 該当データなし
由来 CCUG 45554 <- G.J. Tyrrell, PQ2
他保存機関番号 ATCC BAA-351=CCM 7169=CCUG 45554=CIP 107663=DSM 15690=KCTC 13292
他株番号 PQ2
参考文献
11923322
Enterococcus gilvus sp. nov. and Enterococcus pallens sp. nov. isolated from human clinical specimens. (J Clin Microbiol. 2002)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Acid resistance (by GABA antiporter)(NFUNC_0071)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseI588_01842
GADC
(NRULE_0234)
Glutamate/gamma-aminobutyrate antiporterI588_01843
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseI588_02190 I588_03702
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseI588_00181
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component II588_00180
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseI588_01391
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseI588_04144
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseI588_01099 I588_03618
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseI588_01842
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseI588_03074
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeI588_05063
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinI588_00708 I588_00760 I588_01743
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinI588_00699
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinI588_00699
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinI588_02180
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinI588_00539 I588_05144 I588_02181 I588_02179
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinI588_00542 I588_05143 I588_02178

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA191909
ローカスタグ
INSDC entriesASWD01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数13
サイズ(bp) 5,437,454
遺伝子数 5,201
フィニッシングゴール
アセンブル方法allpaths v. R44557
冗長度
シーケンス方法
  • Illumina
  • PacBio
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
1.6 MB 1.5 MB 976.8 KB 388.5 KB