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微生物 : Ignavibacterium album

微生物株情報

NBRC番号 101810
学名 Ignavibacterium album
別名(シノニム) 該当データなし
由来 NBRC (T. Iino, Mat9-16)
他保存機関番号 DSM 19864=JCM 16511=KCTC 5842
他株番号
参考文献
22661972
Complete Genome of Ignavibacterium album, a Metabolically Versatile, Flagellated, Facultative Anaerobe from the Phylum Chlorobi. (Front Microbiol. 2012)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseIALB_1621
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseIALB_1029
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseIALB_2389
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IIALB_2388
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseIALB_0211
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseIALB_0653
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DIALB_1849
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseIALB_1950
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DIALB_1849
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseIALB_2105
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2IALB_2105
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDIALB_2406
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseIALB_2346
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseIALB_2405
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFIALB_0642

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA61811
ローカスタグIALB
INSDC entriesCP003418
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,658,997
遺伝子数 3,195
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete Genome of Ignavibacterium album, a Metabolically Versatile, Flagellated, Facultative Anaerobe from the Phylum Chlorobi. (Front Microbiol. 2012) PMID: 22661972

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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1.1 MB 1.0 MB 714.5 KB 236.4 KB