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微生物 : Kineococcus radiotolerans

微生物株情報

NBRC番号 101839
学名 Kineococcus radiotolerans
別名(シノニム) 該当データなし
由来 JCM 12686 <- CIP 107704 <- R.W. Phillips, SRS30216 <- C.J. Berry
他保存機関番号 ATCC BAA-149=CIP 107704=DSM 14245=JCM 12686=KACC 20983
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseKrad_0727
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseKrad_1387
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseKrad_1295
C
APH7
(NRULE_0157)
Hygromycin-B 7''-O-kinaseKrad_2754
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AKrad_1931
任意 
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DKrad_0475
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseKrad_0234
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseKrad_1818
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AKrad_1931
D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DKrad_0475
Hygromycin resistance(NFUNC_0055)
必須A
APH7
(NRULE_0157)
Hygromycin-B 7''-O-kinaseKrad_2754
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinKrad_0916 Krad_4178 Krad_4175
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinKrad_4177
F
SOXR
(NRULE_0329)
Redox-sensitive transcriptional activator SoxRKrad_1915
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinKrad_4177
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinKrad_4176
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AKrad_1931
B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DKrad_0475
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseKrad_2879
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseKrad_1295
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseKrad_3074
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseKrad_3075
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeKrad_1306 Krad_3835 Krad_3073
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseKrad_1296
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseKrad_0920
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseKrad_0919
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterKrad_1132
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSKrad_3060
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTKrad_3058

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA10689
ローカスタグKrad
INSDC entriesCP000750
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数3
サイズ(bp) 4,956,672
遺伝子数 4,681
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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TSV
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1.4 MB 1.2 MB 922.3 KB 361.3 KB