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微生物 : Chlorobaculum tepidum

微生物株情報

NBRC番号 103806
学名 Chlorobaculum tepidum
別名(シノニム) Chlorobium tepidum
由来 DSM 12025 <- M.T. Madigan, TLS
他保存機関番号 ATCC 49652=CIP 105973=DSM 12025
他株番号 TLS
参考文献
12892110
Phylogenetic taxonomy of the family Chlorobiaceae on the basis of 16S rRNA and fmo (Fenna-Matthews-Olson protein) gene sequences. (Int J Syst Evol Microbiol. 2003)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCT1922
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCT1565
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICT1448
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCT0329
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCT0450 CT1543 CT1765
B
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorCT1543
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCT1544 CT0670
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRCT0472
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCT0670 CT1544
任意 
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorCT1543
 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinCT0451
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinCT0450
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseCT1591
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2CT1591
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDCT0747
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseCT2037
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseCT0756
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFCT0244
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseCT2088

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA302
ローカスタグCT
INSDC entriesAE006470
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,154,946
遺伝子数 2,255
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • The complete genome sequence of Chlorobium tepidum TLS, a photosynthetic, anaerobic, green-sulfur bacterium. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2002) PMID: 12093901

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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TSV
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650.5 KB 585.3 KB 412.2 KB 163.9 KB