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微生物 : Xylanimonas cellulosilytica

微生物株情報

NBRC番号 107835
学名 Xylanimonas cellulosilytica
別名(シノニム) 該当データなし
由来 LMG 20990 <- E. Velazquez, XIL07 <- R. Rivas
他保存機関番号 CECT 5975=DSM 15894=JCM 12276=LMG 20990
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseXcel_0673
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseXcel_0886
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseXcel_0724
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseXcel_0261
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseXcel_1478
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DXcel_3275
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseXcel_3311
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須E
MPH
(NRULE_0169)
Macrolide 2'-phosphotransferaseXcel_2821
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinXcel_2810 Xcel_2807
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinXcel_2993 Xcel_2808
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinXcel_2808 Xcel_2993
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinXcel_2809
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DXcel_3275
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseXcel_0261
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseXcel_2418
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseXcel_2949
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseXcel_2949
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterXcel_2261
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSXcel_1662
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTXcel_1664

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA19715
ローカスタグXCEL
INSDC entriesCP001821
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 3,831,380
遺伝子数 3,443
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Xylanimonas cellulosilytica type strain (XIL07). (Stand Genomic Sci. 2010) PMID: 21304672

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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1.1 MB 1001.0 KB 720.0 KB 264.8 KB