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微生物 : Tetragenococcus halophilus

微生物株情報

NBRC番号 12172
学名 Tetragenococcus halophilus
別名(シノニム) Pediococcus halophilus
由来 IFO 12172 <- NISL (K. Sakaguchi, d-6)
他保存機関番号 KCTC 3720
他株番号
参考文献
2227360
The phylogeny of Aerococcus and Pediococcus as determined by 16S rRNA sequence analysis: description of Tetragenococcus gen. nov. (FEMS Microbiol Lett. 1990)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseTEH_02030
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseTEH_02480
D
ANT3
(NRULE_0154)
Streptomycin 3''-adenylyltransferaseTEH_23880
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseTEH_03440
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTEH_24030 TEH_14420
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須B
GBSB
(NRULE_0176)
Alcohol dehydrogenaseTEH_04600
BETB
(NRULE_0177)
Betaine aldehyde dehydrogenaseTEH_04590
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseTEH_06860
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTEH_21300
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTEH_21770
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTEH_21770
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinTEH_21800
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseTEH_02480
B
ANT3
(NRULE_0154)
Streptomycin 3''-adenylyltransferaseTEH_23880
C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseTEH_03440
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterTEH_13620

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA41613
ローカスタグTEH
INSDC entriesAP012046
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,562,720
遺伝子数 2,555
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
  • Sanger ABI3730
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
775.5 KB 683.4 KB 470.3 KB 197.8 KB