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微生物 : Zymomonas mobilis subsp. pomaceae

微生物株情報

NBRC番号 13757
学名 Zymomonas mobilis subsp. pomaceae
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 13757 <- J. De Ley, Z.an.a <- Technic. Univ. Delft (J. van der Toorn) <- B.T.P. Barker
他保存機関番号 ATCC 29192=JCM 10191=LMG 448=NCIB 11200=NCIMB 11200=NRRL B-4491
他株番号 Z.an.a
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseZymop_1516
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseZymop_0969 Zymop_1133
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IZymop_0749
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseZymop_0179
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinZymop_1293 Zymop_1292
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinZymop_1296 Zymop_1291
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinZymop_1296 Zymop_1291
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinZymop_1290
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinZymop_1289
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainZymop_1310
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainZymop_1309
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseZymop_0965 Zymop_1311

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA34927
ローカスタグ
INSDC entriesCP002865
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数3
サイズ(bp) 2,061,413
遺伝子数 1,748
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • Sanger
  • 454
  • Illumina
参考文献
  • Genome sequence of the ethanol-producing Zymomonas mobilis subsp. pomaceae lectotype strain ATCC 29192. (J Bacteriol. 2011) PMID: 21742897

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
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623.9 KB 539.7 KB 378.2 KB 139.8 KB