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微生物 : Hyphomonas neptunium

微生物株情報

NBRC番号 14232
学名 Hyphomonas neptunium
別名(シノニム) Hyphomicrobium neptunium
由来 IFO 14232 <- ATCC 15444 <- E. Leifson
他保存機関番号 ATCC 15444=BCRC 10690=DSM 5154=IFAM LE670=NCIMB 2023
他株番号
参考文献
16980487
Comparative genomic evidence for a close relationship between the dimorphic prosthecate bacteria Hyphomonas neptunium and Caulobacter crescentus. (J Bacteriol. 2006)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHNE_2417 HNE_0725
n-alkane hydroxylation(NFUNC_0008)
必須A
CYP153
(NRULE_0041)
Cytochrome P450 CYP153HNE_2042
任意 
RUBA
(NRULE_0039)
RubredoxinHNE_0571
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinHNE_0350 HNE_0143 HNE_2235
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHNE_2368 HNE_1789
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHNE_1790
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseHNE_0965
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBHNE_0992
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseHNE_0991
任意 
ARSH
(NRULE_0021)
ArsH proteinHNE_0990
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHNE_0091
Bioplastic degradation(NFUNC_0015)
必須A
PHAZ1
(NRULE_0023)
Intracellular poly(3-hydroxyalkanoate) depolymeraseHNE_0180
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須A
PHAC1
(NRULE_0010)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymeraseHNE_2313
任意 
PHAB
(NRULE_0011)
Acetoacetyl-CoA reductaseHNE_3404
 
PHAP1
(NRULE_0374)
PhasinHNE_1026
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseHNE_1640
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseHNE_1639
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseHNE_1641
Hydroxyectoine biosynthesis(NFUNC_0057)
必須A
ECTD
(NRULE_0189)
Ectoine hydroxylaseHNE_1642
任意 
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseHNE_1640
 
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseHNE_1639
 
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseHNE_1641
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseHNE_1691
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須F
SOXR
(NRULE_0329)
Redox-sensitive transcriptional activator SoxRHNE_3426
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseHNE_0176
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterHNE_1490

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA15721
ローカスタグHNE
INSDC entriesCP000158
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,705,021
遺伝子数 3,505
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Comparative genomic evidence for a close relationship between the dimorphic prosthecate bacteria Hyphomonas neptunium and Caulobacter crescentus. (J Bacteriol. 2006) PMID: 16980487

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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