English site

微生物 : Bacteroides vulgatus

微生物株情報

NBRC番号 14291
学名 Bacteroides vulgatus
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 14291 <- Daigo Nutritive Chem. (H. Yoshino) <- ATCC 8482 <- A.H. Eggerth
他保存機関番号 ATCC 8482=BCRC 12903=CCUG 4940=CIP 103714=DSM 1447=JCM 5826=LMG 17767=LMG 7956=NBIMCC 3541=NCTC 11154
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseBVU_1765
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ABVU_3257
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseBVU_1171
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ABVU_3257
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseBVU_1202 BVU_3261
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseBVU_3895
Histamine biosynthesis(NFUNC_0078)
必須A
HDCA
(NRULE_0244)
Histidine decarboxylase proenzymeBVU_0329
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinBVU_4193
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinBVU_4193
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseBVU_2899
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseBVU_2746
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseBVU_1204
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseBVU_2898
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ABVU_3257

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA13378
ローカスタグBVU
INSDC entriesCP000139
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 5,163,189
遺伝子数 4,066
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Evolution of symbiotic bacteria in the distal human intestine. (PLoS Biol. 2007) PMID: 17579514

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
1.5 MB 1.4 MB 965.5 KB 320.8 KB