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微生物 : Myroides odoratus

微生物株情報

NBRC番号 14945
学名 Myroides odoratus
別名(シノニム) Flavobacterium odoratum
由来 IFO 14945 <- GIFU 1357 <- RIMD
他保存機関番号 ATCC 4651=CCUG 7321=CIP 103105=DSM 2801=GIFU 1357=JCM 7458=LMG 1233=NCTC 11036
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseMyrod_1440
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseMyrod_3277
D
ANT3
(NRULE_0154)
Streptomycin 3''-adenylyltransferaseMyrod_2991
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseMyrod_0247
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBMyrod_3437
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseMyrod_0902
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseMyrod_2258
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseMyrod_0765 Myrod_3014 Myrod_3494 Myrod_3328
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseMyrod_2721 Myrod_3097
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMyrod_2466
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMyrod_2466
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseMyrod_2001
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseMyrod_2792
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseMyrod_1337
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseMyrod_2000
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseMyrod_2470
Streptogramin resistance(NFUNC_0027)
必須A
VAT
(NRULE_0113)
Streptogramin A acetyltransferaseMyrod_3713
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseMyrod_3277
B
ANT3
(NRULE_0154)
Streptomycin 3''-adenylyltransferaseMyrod_2991
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterMyrod_2152
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterMyrod_2108

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA61389
ローカスタグMYROD
INSDC entriesAHKQ01000000
ステータスWGS
解析状況Improved High-Quality Draft
コンティグ数54
サイズ(bp) 4,296,542
遺伝子数 3,754
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度30x
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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1.3 MB 1.2 MB 784.2 KB 287.9 KB