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微生物 : Lactobacillus helveticus

微生物株情報

NBRC番号 15019
学名 Lactobacillus helveticus
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15019 <- JCM 1120 <- ATCC 15009 <- P.A. Hansen, Lh12 <- S. Orla-Jensen, 12
他保存機関番号 ATCC 15009=DSM 20075=JCM 1120=KCTC 3545
他株番号 12=Lh12
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0518_1062
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseHMPREF0518_1464
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseHMPREF0518_0528
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF0518_0719
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0518_0589
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0518_0589
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseHMPREF0518_0528

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA34619
ローカスタグ
INSDC entriesACLM01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数235
サイズ(bp) 1,808,667
遺伝子数 2,078
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度34x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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549.1 KB 518.7 KB 343.4 KB 169.6 KB