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微生物 : Magnetospirillum gryphiswaldense

微生物株情報

NBRC番号 15271
学名 Magnetospirillum gryphiswaldense
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15271 <- DSM 6361 <- D. Schuler, MSR-1
他保存機関番号 DSM 6361=IAM 14722=JCM 21280
他株番号 MSR-1
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseMGR_2278
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseMGR_0593
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IMGR_0566
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseMGR_0955
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBMGR_2153
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseMGR_0182
E
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBMGR_2153
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseMGR_2155
任意 
ARSA
(NRULE_0014)
Arsenical pump-driving ATPaseMGR_2151
 
ARSD
(NRULE_0020)
Arsenical resistance operon trans-acting repressor ArsDMGR_2152
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseMGR_3495
Bioplastic degradation(NFUNC_0015)
必須A
PHAZ1
(NRULE_0023)
Intracellular poly(3-hydroxyalkanoate) depolymeraseMGR_0212
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須A
PHAC1
(NRULE_0010)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymeraseMGR_0024
任意 
PHAB
(NRULE_0011)
Acetoacetyl-CoA reductaseMGR_4242
 
PHAP1
(NRULE_0374)
PhasinMGR_0507 MGR_2633 MGR_0659 MGR_2526
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinMGR_3773 MGR_3405 MGR_2649 MGR_3406
B
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorMGR_3405
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMGR_3407 MGR_2653 MGR_3658
E
CUER
(NRULE_0328)
Copper-responsive transcriptional regulator CueRMGR_1215
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMGR_3658 MGR_2653 MGR_3407
任意 
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorMGR_3405
 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinMGR_3774
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinMGR_3773
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainMGR_1431
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainMGR_1432
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseMGR_1430
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseMGR_2800
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2MGR_2800 MGR_2751
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDMGR_2798
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseMGR_2801
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseMGR_2799
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFMGR_2366

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJEA19063
ローカスタグ
INSDC entriesCU459003
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 4,337,911
遺伝子数 4,306
フィニッシングゴール
アセンブル方法Phrap; version 0.990329
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Comparative genome analysis of four magnetotactic bacteria reveals a complex set of group-specific genes implicated in magnetosome biomineralization and function. (J Bacteriol. 2007) PMID: 17449609

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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