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微生物 : Corynebacterium striatum

微生物株情報

NBRC番号 15291
学名 Corynebacterium striatum
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15291 <- ATCC 6940 <- NCTC 764 <- F.C. Minett
他保存機関番号 ATCC 6940=CCUG 27949=CIP 81.15=DSM 20668=JCM 9390=NCTC 764
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0308_1538
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHMPREF0308_2491 HMPREF0308_0355
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHMPREF0308_2492
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0308_0615
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須A
BETA
(NRULE_0175)
Choline dehydrogenaseHMPREF0308_2352
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF0308_0051
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseHMPREF0308_0197
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF0308_1668
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0308_0111
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0308_0111
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須C
PHEA2
(NRULE_0084)
Aromatic ring hydroxylaseHMPREF0308_2494
任意 
FDR1
(NRULE_0032)
Oxygenase electron transfer componentHMPREF0308_2553
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinHMPREF0308_0935 HMPREF0308_2482
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseHMPREF0308_0083
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseHMPREF0308_1662
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseHMPREF0308_2618
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseHMPREF0308_2616
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterHMPREF0308_0774 HMPREF0308_0444 HMPREF0308_2353
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterHMPREF0308_0091
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSHMPREF0308_1601
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTHMPREF0308_1602

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA31449
ローカスタグHMPREF0308
INSDC entriesACGE01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数176
サイズ(bp) 2,724,288
遺伝子数 2,677
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度28x
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
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830.1 KB 790.4 KB 517.5 KB 218.5 KB