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微生物 : Jonesia denitrificans

微生物株情報

NBRC番号 15587
学名 Jonesia denitrificans
別名(シノニム) Listeria denitrificans
由来 IFO 15587 <- ATCC 14870 <- CIP 55.134 <- R. Sohier L26
他保存機関番号 ATCC 14870=CCUG 15532=CIP 55.134=DSM 20603=JCM 11481=NCTC 10816
他株番号
参考文献
21304666
Complete genome sequence of Jonesia denitrificans type strain (Prevot 55134). (Stand Genomic Sci. 2009)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseJden_0627
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseJden_0168
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IJden_1212
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseJden_1194
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinJden_2065 Jden_1854
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinJden_1853 Jden_0314
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinJden_0314 Jden_1853
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinJden_1852
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseJden_1728
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseJden_2063
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseJden_2064
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterJden_0022
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSJden_1600
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTJden_1601

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA20833
ローカスタグJDEN
INSDC entriesCP001706.1
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,749,646
遺伝子数 2,511
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Jonesia denitrificans type strain (Prevot 55134). (Stand Genomic Sci. 2009) PMID: 21304666

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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TSV
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832.7 KB 760.1 KB 525.4 KB 192.1 KB