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微生物 : Acidobacterium capsulatum

微生物株情報

NBRC番号 15755
学名 Acidobacterium capsulatum
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15755 <- Mimasaka Women's Junior Coll. (N. Kishimoto, 161)
他保存機関番号 ATCC 51196=DSM 11244=JCM 7670=NCIMB 13165
他株番号 161
参考文献
23835745
Acidiphilium aminolytica sp. nov.: An acidophilic chemoorganotrophic bacterium isolated from acidic mineral environment. (Curr Microbiol. 1993)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseACP_2160
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AACP_3424
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseACP_2879
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IACP_2882
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseACP_2205
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseACP_3099
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須E
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBACP_3443
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseACP_3442
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AACP_3424
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinACP_0227
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinACP_0006 ACP_0008 ACP_0226 ACP_2404 ACP_0007
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinACP_0008 ACP_0226 ACP_2404 ACP_0006 ACP_0007
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinACP_0225
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinACP_0224
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AACP_3424
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseACP_2719
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseACP_2720
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeACP_0709
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseACP_0842
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSACP_0459
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTACP_0458

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA28085
ローカスタグ
INSDC entriesCP001472
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,127,356
遺伝子数 3,382
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Three genomes from the phylum Acidobacteria provide insight into the lifestyles of these microorganisms in soils. (Appl Environ Microbiol. 2009) PMID: 19201974

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
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FASTA
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TSV
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1.2 MB 1.1 MB 762.5 KB 261.9 KB