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微生物 : Frateuria aurantia

微生物株情報

NBRC番号 3245
学名 Frateuria aurantia
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 3245 <- IFO (K. Kondo, 67)
他保存機関番号 ATCC 33424=DSM 6220=KCTC 2777=LMG 1558
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseFraau_3165
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseFraau_2176
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IFraau_2666
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseFraau_2394
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseFraau_0036
Bioplastic degradation(NFUNC_0015)
必須A
PHAZ1
(NRULE_0023)
Intracellular poly(3-hydroxyalkanoate) depolymeraseFraau_2407
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須B
PHAE
(NRULE_0012)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaE subunitFraau_1099
PHAC2
(NRULE_0373)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaC subunitFraau_1100
任意 
PHAB
(NRULE_0011)
Acetoacetyl-CoA reductaseFraau_0742
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseFraau_0175
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseFraau_2321
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDFraau_0760
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseFraau_0176
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinFraau_0561
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFraau_0587
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFraau_0587
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseFraau_2543
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseFraau_2545
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseFraau_0824
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseFraau_2544
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseFraau_0285
任意 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BFraau_0284
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EFraau_0287

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA64505
ローカスタグFraau
INSDC entriesCP003350
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,603,458
遺伝子数 3,101
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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1.1 MB 938.2 KB 671.1 KB 255.9 KB