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微生物 : Candidatus Solibacter usitatus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Candidatus Solibacter usitatus
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 Ellin6076
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAcid_7398
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAcid_2285
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseAcid_0987
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IAcid_0987
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseAcid_2800
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseAcid_5064
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAcid_2285
C
BLAC
(NRULE_0124)
Beta-lactamase class CAcid_7087 Acid_5605
Cephalosporin resistance(NFUNC_0048)
必須A
BLAC
(NRULE_0124)
Beta-lactamase class CAcid_5605 Acid_7087
任意 
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAcid_2285
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseAcid_1894
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinAcid_5434
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAcid_5436
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRAcid_6713
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAcid_5436
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinAcid_5435
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAcid_2285
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseAcid_1908
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Acid_1908 Acid_2182
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDAcid_4222
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseAcid_6223
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseAcid_4223
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFAcid_1839
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseAcid_0220
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseAcid_0218
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeAcid_2891 Acid_7170 Acid_0219
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSAcid_0290
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTAcid_0289

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA12638
ローカスタグACID
INSDC entriesCP000473
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 9,965,640
遺伝子数 7,826
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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2.9 MB 2.8 MB 1.8 MB 590.6 KB