English site

微生物 : Thermodesulfovibrio yellowstonii

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Thermodesulfovibrio yellowstonii
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 11347
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseTHEYE_A0341
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseTHEYE_A0507
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ITHEYE_A0506
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTHEYE_A1979
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseTHEYE_A1333
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseTHEYE_A1731
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDTHEYE_A1875
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseTHEYE_A0809
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTHEYE_A1143
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainTHEYE_A1716
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainTHEYE_A1715
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseTHEYE_A1717
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseTHEYE_A1874
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseTHEYE_A0277
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseTHEYE_A1601 THEYE_A1653
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseTHEYE_A0461
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseTHEYE_A0208
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2THEYE_A0208
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDTHEYE_A1298
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseTHEYE_A1847
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseTHEYE_A0097
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFTHEYE_A0704

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA30733
ローカスタグTHEYE
INSDC entriesCP001147
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,003,803
遺伝子数 2,033
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Genome Sequence of the Sulfate-Reducing Thermophilic Bacterium Thermodesulfovibrio yellowstonii Strain DSM 11347T (Phylum Nitrospirae). (Genome Announc. 2015) PMID: 25635016

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
597.0 KB 603.2 KB 393.3 KB 163.3 KB