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微生物 : Nitriliruptor alkaliphilus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Nitriliruptor alkaliphilus
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 45188
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseNitalDRAFT_0327
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseNitalDRAFT_0863
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component INitalDRAFT_3795
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBNitalDRAFT_0547
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseNitalDRAFT_2769
任意 
ARSA
(NRULE_0014)
Arsenical pump-driving ATPaseNitalDRAFT_3890 NitalDRAFT_2433
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseNitalDRAFT_1706
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須A
BETA
(NRULE_0175)
Choline dehydrogenaseNitalDRAFT_0555
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseNitalDRAFT_4158
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseNitalDRAFT_4157
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseNitalDRAFT_4159
Hydroxyectoine biosynthesis(NFUNC_0057)
必須A
ECTD
(NRULE_0189)
Ectoine hydroxylaseNitalDRAFT_4160
任意 
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseNitalDRAFT_4158
 
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseNitalDRAFT_4157
 
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseNitalDRAFT_4159
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseNitalDRAFT_4911
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinNitalDRAFT_1310 NitalDRAFT_3282
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinNitalDRAFT_1004 NitalDRAFT_1308
F
SOXR
(NRULE_0329)
Redox-sensitive transcriptional activator SoxRNitalDRAFT_4852
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinNitalDRAFT_1308 NitalDRAFT_1004
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinNitalDRAFT_1309
Nitrile hydratase(NFUNC_0002)
必須A
NHAA
(NRULE_0001)
Nitrile hydratase subunit alphaNitalDRAFT_4623
NHAB
(NRULE_0002)
Nitrile hydratase subunit betaNitalDRAFT_4622
任意 
P14K
(NRULE_0006)
Nitrile hydratase activator P14KNitalDRAFT_4624
 
COBW
(NRULE_0007)
CobW/P47K family proteinNitalDRAFT_1551
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseNitalDRAFT_3914
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseNitalDRAFT_3916
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeNitalDRAFT_3915
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseNitalDRAFT_3919
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterNitalDRAFT_1845 NitalDRAFT_0706
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterNitalDRAFT_0503
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSNitalDRAFT_3333
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTNitalDRAFT_3334

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA82631
ローカスタグNITAL
INSDC entriesLATF00000000
ステータスScaffold
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 5,558,097
遺伝子数 5,016
フィニッシングゴールImproved High-Quality Draft
アセンブル方法ALLPATHS v. R37654
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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1.6 MB 1.5 MB 1.0 MB 447.5 KB