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Adria_00260 : CDS information

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Organism
StrainATCC 29050 (=NBRC 100596)
Entry nameDoxorubicin
Contig
Start / Stop / Direction26,862 / 27,251 / + [in whole cluster]
2,872 / 3,261 / + [in contig]
Location26862..27251 [in whole cluster]
2872..3261 [in contig]
TypeCDS
Length390 bp (129 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productputative C-12 oxygenase
Product (GenBank)anthraquinol monooxygenase
GenednrG
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • anthraquinone
Note
Note (GenBank)
  • ORF8; putative
Reference
ACC
PmId
[7828855] Characterization of the Streptomyces peucetius ATCC 29050 genes encoding doxorubicin polyketide synthase. (Gene. , 1994)
comment
daunorubicin (DNR)-doxorubicin (DXR) PKSを含む領域9ORFsの同定論文。

ORF8: monooxygenase

配列解析のみ。
TcmHに似ているので、12-deoxyaklanonic acd→aklanonic acidへのoxidationを担うかもしれない。
Related Reference
ACC
Q8VWB4
PmId
[12399480] Expression, purification, and characterization of AknX anthrone oxygenase, which is involved in aklavinone biosynthesis in Streptomyces galilaeus. (J Bacteriol. , 2002)
comment
Blast 4th, id49%, 1e-19
Streptomyces galilaeus(3AR-33)_aknX
AknX

AknXをE.coliで過剰発現、精製、酵素活性測定。
emodinanthrone → anthraquinone emodinへ変換するanthrone oxygenase activity確認あり。
TcmHのようなoxygen activationのための補欠分子族を持たないので、peroxy anion intermediateを介した異なるメカニズムが提唱されている。

anthranol anionの形成で反応は始まり、それは固定された向きでTrp-67とのπ-π複合体形成によって安定化される。それからhydroperoxyanthroneがdioxygen添加によって形成され、続いてanthraquinone形成のためにdehydrateされる、と提唱されている(Fig9)。

DnrG/DauGを含んだalignment、系統樹作成あり。
実験結果と配列解析から、AknXと、DnrG and SnoaBのような関連遺伝子産物は、anthrone precursor(12-deoxyaklanonic acid)からのaklanonic acid形成に関与すると述べられている。
ACC
O54259
NITE
Nogl_00350
PmId
[19255477] Expression, purification and crystallization of the cofactor-independent monooxygenase SnoaB from the nogalamycin biosynthetic pathway. (Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. , 2009)
[20052967] Crystal structure of the cofactor-independent monooxygenase SnoaB from Streptomyces nogalater: implications for the reaction mechanism. (Biochemistry. , 2010)
comment
Blast 6th, id46%, 3e-18
Streptomyces nogalater_snoaB
SnoaB

--
[PMID: 19255477](2009)
SnoaBは、
12-deoxy-nogalonic acid → nogalonic acid
へのposition12でのoxygenationを触媒する12-deoxy-nogalonic acid oxygenaseである。

prosthetic group, cofactor or metal ionの助けなしにoxygenation反応を実行するsmall cofactor-free oxygenasesのfamilyに属する。
methinonine→selenomethionine置換したmutantでoxygenase activityを測定して、wildと比較している。

--
[PMID: 20052967](2010) abstract
vitroでの(18)O2実験で、基質に取り込まれた酸素原子が酸素分子に由来することを確認。
結晶構造解析、site-directed mutagenesis実験により酵素反応に重要な残基を同定し、反応メカニズムを提唱。

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selected fasta
>putative C-12 oxygenase [anthraquinol monooxygenase]
MPQPEPNDAGSGSVTFVNRFTLSGSAEDFEAAFAETAEFLCRRPGFRWHALLVPADTGPG
SADARPQYVNIAVWDDEASFRAAVAHPEFPAHAAALRALSTSEPTLYRHRQIRVAPDVPA
VSGPGGRTT
selected fasta
>putative C-12 oxygenase [anthraquinol monooxygenase]
ATGCCACAGCCAGAACCGAACGACGCCGGCTCCGGGTCGGTGACGTTCGTCAACCGATTC
ACCCTGAGCGGATCCGCCGAGGACTTCGAGGCGGCGTTCGCCGAAACGGCCGAGTTCCTG
TGTCGCCGGCCCGGCTTCCGCTGGCACGCCCTGCTGGTGCCGGCCGACACCGGTCCCGGC
TCGGCGGACGCCCGCCCGCAGTACGTGAACATCGCGGTCTGGGACGACGAGGCCTCCTTC
CGCGCCGCCGTGGCACACCCGGAGTTCCCGGCCCACGCGGCCGCCCTTCGGGCCCTGAGC
ACCAGCGAACCGACCCTGTACCGGCACCGTCAGATCCGTGTCGCGCCGGACGTCCCGGCC
GTGAGCGGGCCCGGAGGGCGGACGACGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR007138 Antibiotic biosynthesis monooxygenase (Domain)
[14-94] 5.20000000000001e-20 PF03992
PF03992   ABM
IPR011008 Dimeric alpha-beta barrel (Domain)
[4-121] 1.99999636034521e-19 SSF54909
SSF54909   Dimer_A_B_barrel
SignalP
[1-31] 0.329 Signal
Bacteria, Gram-positive   
[1-26] 0.281 Signal
Bacteria, Gram-negative   
TMHMM No significant hit
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