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微生物 : Thermodesulfobium narugense

微生物株情報

NBRC番号 100082
学名 Thermodesulfobium narugense
別名（シノニム） 該当データなし
由来 AIST (K. Mori, Na82)
他保存機関番号 DSM 14796=JCM 11510
他株番号
参考文献
12910388
A novel lineage of sulfate-reducing microorganisms: Thermodesulfobiaceae fam. nov., Thermodesulfobium narugense, gen. nov., sp. nov., a new thermophilic isolate from a hot spring. (Extremophiles. 2003)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseThena_0239
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseThena_1839
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IThena_1838
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseThena_0847
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinThena_1276 Thena_1848
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinThena_1848 Thena_1276
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinThena_1847
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseThena_0443
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseThena_1283
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseThena_1132
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseThena_0292
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseThena_1542
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Thena_1542
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDThena_1001
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseThena_1543
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseThena_1782
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFThena_0612

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA46673
ローカスタグTHENA
INSDC entriesCP002690
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,898,865
遺伝子数 1,807
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
570.2 KB 532.7 KB 376.7 KB 142.3 KB