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微生物 : Congregibacter litoralis

微生物株情報

NBRC番号 104960
学名 Congregibacter litoralis
別名（シノニム） 該当データなし
由来 DSM 17192 <- Max Planck Inst. (R. Amann, KT71)
他保存機関番号 CECT 7588=DSM 17192
他株番号 KT71
参考文献
17299055
Characterization of a marine gammaproteobacterium capable of aerobic anoxygenic photosynthesis. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2007)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseKT71_17236
n-alkane hydroxylation(NFUNC_0008)
必須A
CYP153
(NRULE_0041)
Cytochrome P450 CYP153KT71_14444 KT71_02837
任意 
RUBA
(NRULE_0039)
RubredoxinKT71_05015 KT71_10637
 
RUBB
(NRULE_0040)
Rubredoxin reductaseKT71_05015
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinKT71_16051 KT71_02567 KT71_10307 KT71_08089
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseKT71_02157
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IKT71_02162
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseKT71_17636
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須E
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBKT71_13789 KT71_17576
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseKT71_13794
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseKT71_16856
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseKT71_10964
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseKT71_16211
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinKT71_03700
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinKT71_03690
I
ISCR
(NRULE_0332)
Rrf2 family transcriptional regulator IscRKT71_06764
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinKT71_03690
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinKT71_03695
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinKT71_03700
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseKT71_01400 KT71_14079
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2KT71_14079 KT71_01400 KT71_01370
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDKT71_01410
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseKT71_01395
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseKT71_01405
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFKT71_19692
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterKT71_03950
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterKT71_02707

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA13585
ローカスタグKT71
INSDC entriesAAOA01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数32
サイズ(bp) 4,328,100
遺伝子数 3,941
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Characterization of a marine gammaproteobacterium capable of aerobic anoxygenic photosynthesis. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2007) PMID: 17299055
  • The photosynthetic apparatus and its regulation in the aerobic gammaproteobacterium Congregibacter litoralis gen. nov., sp. nov. (PLoS One. 2009) PMID: 19287491

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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