微生物 : Salinispora tropica
微生物株情報
| NBRC番号 | 105044![]() |
|---|---|
| 学名 | Salinispora tropica |
| 別名(シノニム) | 該当データなし |
| 由来 | JCM 13857 <- DSM 44818 <- P.R. Jensen, CNB-440 |
| 他保存機関番号 | ATCC BAA-916=BCRC 16822=CIP 108943=DSM 44818=JCM 13857 |
| 他株番号 | CNB-440 |
| 参考文献 |
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推定保有機能 >>詳細
ゲノム配列情報
| BioProject ID | PRJNA16342 |
|---|---|
| ローカスタグ | |
| INSDC entries | CP000667 |
| ステータス | Complete |
| 解析状況 | |
| コンティグ数 | 1 |
| サイズ(bp) | 5,183,331 |
| 遺伝子数 | 4,536 |
| フィニッシングゴール | |
| アセンブル方法 | |
| 冗長度 | |
| シーケンス方法 |
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参考文献
- Genome sequencing reveals complex secondary metabolome in the marine actinomycete Salinispora tropica. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2007) PMID: 17563368
- Biosynthesis of the salinosporamide A polyketide synthase substrate chloroethylmalonyl-coenzyme A from S-adenosyl-L-methionine. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2009) PMID: 19590008
データダウンロード
| ゲノム塩基配列 | CDS塩基配列 | CDSアミノ酸変換配列 | 遺伝子/ORF リスト |
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| FASTA gz |
FASTA gz |
FASTA gz |
TSV uncompressed |
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| 1.5 MB | 1.3 MB | 946.3 KB | 347.4 KB |






