English site

微生物 : Corynebacterium ammoniagenes

微生物株情報

NBRC番号 12612
学名 Corynebacterium ammoniagenes
別名（シノニム） Brevibacterium ammoniagenes
由来 IFO 12612 <- Shizuoka Univ <- ATCC 6871 <- NCTC 2398 <- J. V. Cooke
他保存機関番号 ATCC 6871=CCUG 38796=CIP 101283=DSM 20306=JCM 1305=NBRC 12071=NCCB 60030=NCIB 8143=NCIMB 8143=NCTC 2398=VKM B-672
他株番号
参考文献
16559250
A TYPE OF UREA-SPLITTING BACTERIUM FOUND IN THE HUMAN INTESTINAL TRACT. (J Bacteriol. 1927)

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0281_01805
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHMPREF0281_01617
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHMPREF0281_01071
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0281_00400
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須C
CHOX
(NRULE_0178)
Choline oxidaseHMPREF0281_02587
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF0281_01967
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseHMPREF0281_01658
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0281_02495 HMPREF0281_02020
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0281_02495 HMPREF0281_02020
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須C
PHEA2
(NRULE_0084)
Aromatic ring hydroxylaseHMPREF0281_01056 HMPREF0281_00614
任意 
FDR1
(NRULE_0032)
Oxygenase electron transfer componentHMPREF0281_01019 HMPREF0281_01037 HMPREF0281_00564
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinHMPREF0281_00013 HMPREF0281_00561
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseHMPREF0281_00547 HMPREF0281_00572
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseHMPREF0281_01450
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseHMPREF0281_01452
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterHMPREF0281_00750 HMPREF0281_02585 HMPREF0281_02543 HMPREF0281_02418 HMPREF0281_02302
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterHMPREF0281_01999

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA38319
ローカスタグHMPREF0281
INSDC entriesADNS01000000
ステータスWGS
解析状況High-Quality Draft
コンティグ数34
サイズ(bp) 2,763,612
遺伝子数 2,654
フィニッシングゴールHigh-Quality Draft
アセンブル方法Velvet v. 0.7.59
冗長度76.5x
シーケンス方法
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
842.9 KB 812.0 KB 529.8 KB 224.8 KB