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微生物 : Nitrosomonas europaea

微生物株情報

NBRC番号 14298
学名 Nitrosomonas europaea
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 14298 <- IFO (T. Sakane, NS-5-2, single cell isolate) <- Tokyo Inst. of Technol. (T. Yamanaka) <- J.D. Nicholas
他保存機関番号 ATCC 19718=HUT 8107=VTCC D10-12
他株番号 NS-5-2
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseNE1417
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseNE0014
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component INE2150
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseNE0039
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseNE2299
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseNE0026
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDNE2296
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseNE2300
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseNE0839
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseNE2556
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2NE2556
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDNE0793
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseNE2557
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseNE2555
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFNE1150

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA52
ローカスタグNE
INSDC entriesAL954747
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,812,094
遺伝子数 2,462
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of the ammonia-oxidizing bacterium and obligate chemolithoautotroph Nitrosomonas europaea. (J Bacteriol. 2003) PMID: 12700255

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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