English site

微生物 : Chlorobium limicola

微生物株情報

NBRC番号 103803
学名 Chlorobium limicola
別名(シノニム) 該当データなし
由来 DSM 245 <- N. Pfennig, 6330
他保存機関番号 DSM 245
他株番号 6330
参考文献
12892110
Phylogenetic taxonomy of the family Chlorobiaceae on the basis of 16S rRNA and fmo (Fenna-Matthews-Olson protein) gene sequences. (Int J Syst Evol Microbiol. 2003)

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseClim_2128
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseClim_0394
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IClim_1674
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseClim_1735
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinClim_0373 Clim_0673
B
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorClim_0673
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinClim_0675 Clim_0374
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRClim_2003
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinClim_0374 Clim_0675
任意 
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorClim_0673
 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinClim_0372
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinClim_0371
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainClim_0682
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainClim_0681
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseClim_0685
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseClim_1122
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseClim_1966 Clim_0178
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Clim_1966
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDClim_0829
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseClim_2336
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseClim_0835
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFClim_0303
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseClim_2378

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA12606
ローカスタグCLIM
INSDC entriesCP001097
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,763,181
遺伝子数 2,434
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
829.9 KB 727.2 KB 510.5 KB 191.5 KB