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微生物 : Turicella otitidis

微生物株情報

NBRC番号 106139
学名 Turicella otitidis
別名(シノニム) 該当データなし
由来 LMG 19071 <- CIP 104075 <- Univ. Zurich (G. Funke, 234/92)
他保存機関番号 ATCC 51513=CCM 4568=CCUG 32254=CIP 104075=DSM 8821=IFM 10650=JCM 12146=LMG 19071
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF9719_01506
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHMPREF9719_01781
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHMPREF9719_01817
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF9719_00669
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須C
CHOX
(NRULE_0178)
Choline oxidaseHMPREF9719_01009
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF9719_00969
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseHMPREF9719_01326
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF9719_00940
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF9719_00940
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterHMPREF9719_00465 HMPREF9719_00416 HMPREF9719_01006 HMPREF9719_00996
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterHMPREF9719_00148 HMPREF9719_00947

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA52203
ローカスタグHMPREF9719
INSDC entriesAHAE01000000
ステータスWGS
解析状況High-Quality Draft
コンティグ数87
サイズ(bp) 2,090,523
遺伝子数 1,846
フィニッシングゴールHigh-Quality Draft
アセンブル方法allpaths v. R39980
冗長度214x
シーケンス方法
  • Illumina
参考文献

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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606.4 KB 548.0 KB 374.5 KB 148.1 KB