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微生物 : Methylacidiphilum infernorum

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Methylacidiphilum infernorum
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 V4
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseMinf_0070
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseMinf_1763
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IMinf_1764
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseMinf_1829
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須E
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBMinf_1584
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseMinf_1582
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseMinf_0812
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DMinf_1718
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseMinf_0102
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseMinf_0451
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMinf_0987
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMinf_0987
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinMinf_0988
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainMinf_1874
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainMinf_1873
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseMinf_1876
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DMinf_1718
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseMinf_1235
任意 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BMinf_1234
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EMinf_1237
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseMinf_1019
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseMinf_1020
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeMinf_0536
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseMinf_1021

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA28995
ローカスタグMINF
INSDC entriesCP000975
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,287,145
遺伝子数 2,472
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of the extremely acidophilic methanotroph isolate V4, Methylacidiphilum infernorum, a representative of the bacterial phylum Verrucomicrobia. (Biol Direct. 2008) PMID: 18593465

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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692.3 KB 681.6 KB 447.7 KB 199.8 KB