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微生物 : Ardenticatena maritima

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Ardenticatena maritima
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 110S
参考文献
26430053
Draft Genome Sequence of a Heterotrophic Facultative Anaerobic Thermophilic Bacterium, Ardenticatena maritima Strain 110ST. (Genome Announc. 2015)
26586887
Draft Genome Sequence of Ardenticatena maritima 110S, a Thermophilic Nitrate- and Iron-Reducing Member of the Chloroflexi Class Ardenticatenia. (Genome Announc. 2015)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseARMA_0961
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseARMA_1878
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IARMA_1877
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseARMA_1799
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseARMA_1653
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinARMA_2171
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinARMA_1367 ARMA_0193 ARMA_1100
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinARMA_1367 ARMA_0193 ARMA_1100
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinARMA_1868
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseARMA_1604
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2ARMA_1604
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDARMA_1602
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseARMA_1605
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseARMA_1603
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFARMA_1707
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSARMA_0615
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTARMA_0616

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDB4052
ローカスタグARMA
INSDC entriesBBZA00000000
ステータス
解析状況
コンティグ数308
サイズ(bp) 3,569,367
遺伝子数 2,765
フィニッシングゴール
アセンブル方法Velvet v. 2.2.5
冗長度68x
シーケンス方法
  • Illumina MiSeq
参考文献
  • Draft Genome Sequence of a Heterotrophic Facultative Anaerobic Thermophilic Bacterium, Ardenticatena maritima Strain 110ST. (Genome Announc. 2015) PMID: 26430053
  • Draft Genome Sequence of Ardenticatena maritima 110S, a Thermophilic Nitrate- and Iron-Reducing Member of the Chloroflexi Class Ardenticatenia. (Genome Announc. 2015) PMID: 26586887

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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1.0 MB 953.9 KB 631.2 KB 230.3 KB