相同性検索(BLAST)から探す

塩基配列、またはアミノ酸配列で、相同性のある配列や相同性のある配列を持つ微生物を検索することができます。

クエリ配列(FASTA 形式)

配列ファイルをアップロード

または、配列を入力してください。

ご注意

・クエリ配列が多い・サイズが大きいと、BLAST完了までに非常に時間がかかります。

・BLAST実行がなかなか終わらない場合は、クエリ配列を分割してBLASTの再実行をお願いします。

・お困りの際はお問い合わせフォームから連絡をお願いします。

データセット

NBRC株CDS領域(MiFuP掲載データ)(アミノ酸)
NBRC株の遺伝子領域(塩基)
NBRC株ゲノム(DBRP掲載データ)(塩基)
味の素株16S rDNA配列データ(塩基)
国内由来RD株の同定に用いた遺伝子領域(塩基)

プログラム

blastn
(megablast)
tblastx
blastx
tblastn
blastp

オプション

SCORES
ALIGNMENTS
EXPECT
FILTER ONOFF
WORD SIZE

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