解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000000128
データタイトル ゲノム(Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名 Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261
アクセッション番号またはID BBJU00000000
コメント Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261, whole genome shotgun sequencing project.
ゲノム配列のバージョン BBJU00000000.1
登録日または更新日 2014-08-02
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
CDSファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc) 56
形態 linear
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain NBRC 13261
分離源
plasmid
備考
菌株へのコメント The Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession BBJU00000000. This version of the project (01) has the accession number BBJU01000000, and consists of sequences BBJU01000001-BBJU01000056.; ~~Strain NBRC 13261 available from NBRC culture collection (http://www.nbrc.nite.go.jp/e/).~The NBRC Whole Genome Shotgun Project aims to provide 'reference genomes' of NBRC culture collection strains for identifying useful genes for taxonomic classification, risk/safety assessment, and industrial application, and for understanding the structure and evolution of microbial genomes.~(http://www.bio.nite.go.jp/ngac/e/project_wgs-e.html).; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Finishing Goal :: Noncontiguous Finished ; Current Finishing Status :: High-Quality Draft ; Assembly Method :: newbler v. 2.6 ; Genome Coverage :: 115x ; Sequencing Technology :: 454 GS-FLX Titanium; Illumina HiSeq 1000 ; ##Genome-Assembly-Data-END##
参照 1
  タイトル Whole genome shotgun sequence of Rhizobium rubi NBRC 13261
  雑誌名/登録機関名 Unpublished
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Katano-Makiyama,Y. Hosoyama,A. Hashimoto,M. Hosoyama,Y. Noguchi,M. Tsuchikane,K. Uohara,A. Ohji,S. Ichikawa,N. Kimura,A. Yamazoe,A. Fujita,N.
  PubMed
参照 2
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (01-AUG-2014) Contact:Director-General Biological Resource Center National Institute of Technology and Evaluation, NITE Biological Resource Center; 2-49-10 Nishihara, Shibuya-ku, Tokyo 151-0066, Japan URL :http://www.bio.nite.go.jp/
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Hosoyama,A. Kimura,A. Ohji,S. Ichikawa,N. Yamazoe,A. Fujita,N.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

Not found

7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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