データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名(著者名含) | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株(変異株の場合) | 付加情報 |
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データID | ANGE0000000000128 |
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データタイトル | ゲノム(Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261, whole genome shotgun sequencing project) |
生物種名 | Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261 |
アクセッション番号またはID | BBJU00000000 |
コメント | Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261, whole genome shotgun sequencing project. |
ゲノム配列のバージョン | BBJU00000000.1 |
登録日または更新日 | 2014-08-02 |
配列取得用URL | |
配列ファイルダウンロード | |
CDSファイルダウンロード | |
配列長(bp)または配列数(rc) | 56 |
形態 | linear |
BioProject | |
BioSample | |
配列の種類 | genomic DNA |
strain | NBRC 13261 |
分離源 | |
plasmid | |
備考 | |
菌株へのコメント | The Agrobacterium rubi TR3 = NBRC 13261 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession BBJU00000000. This version of the project (01) has the accession number BBJU01000000, and consists of sequences BBJU01000001-BBJU01000056.; ~~Strain NBRC 13261 available from NBRC culture collection (http://www.nbrc.nite.go.jp/e/).~The NBRC Whole Genome Shotgun Project aims to provide 'reference genomes' of NBRC culture collection strains for identifying useful genes for taxonomic classification, risk/safety assessment, and industrial application, and for understanding the structure and evolution of microbial genomes.~(http://www.bio.nite.go.jp/ngac/e/project_wgs-e.html).; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Finishing Goal :: Noncontiguous Finished ; Current Finishing Status :: High-Quality Draft ; Assembly Method :: newbler v. 2.6 ; Genome Coverage :: 115x ; Sequencing Technology :: 454 GS-FLX Titanium; Illumina HiSeq 1000 ; ##Genome-Assembly-Data-END## |
参照 | 1 |
タイトル | Whole genome shotgun sequence of Rhizobium rubi NBRC 13261 |
雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | Katano-Makiyama,Y. Hosoyama,A. Hashimoto,M. Hosoyama,Y. Noguchi,M. Tsuchikane,K. Uohara,A. Ohji,S. Ichikawa,N. Kimura,A. Yamazoe,A. Fujita,N. |
PubMed | |
参照 | 2 |
タイトル | Direct Submission |
雑誌名/登録機関名 | Submitted (01-AUG-2014) Contact:Director-General Biological Resource Center National Institute of Technology and Evaluation, NITE Biological Resource Center; 2-49-10 Nishihara, Shibuya-ku, Tokyo 151-0066, Japan URL :http://www.bio.nite.go.jp/ |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | Hosoyama,A. Kimura,A. Ohji,S. Ichikawa,N. Yamazoe,A. Fujita,N. |
PubMed | |
関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
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7.コレクション情報
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