| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000000381 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 chromosome 2, complete sequence） |
| 生物種名 | Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 |
| アクセッション番号またはID | CP016346 |
| コメント | Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 chromosome 2, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | CP016346.1 |
| 登録日または更新日 | 2016-07-06 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 1927156 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | ATCC 14048 |
| 分離源 | salt marsh mud |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | Annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (released 2013). Information about the Pipeline can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; This genome has a base modification file available.; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: HGAP v. 2 ; Genome Coverage :: 178.8x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 07/01/2016 12:02:29 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS+ ; Annotation Software revision :: 3.3 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 4,654 ; CDS (total) :: 4,484 ; Genes (coding) :: 4,467 ; CDS (coding) :: 4,467 ; Genes (RNA) :: 170 ; rRNAs :: 13, 12, 12 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 13, 12, 12 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 129 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 17 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 17 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 10 of 17 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 5 of 17 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 17 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 17 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Developing Vibrio natriegens as a novel, fast-growing host for biotechnology |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Weinstock,M.T. Hesek,E.D. Wilson,C.M. Gibson,D.G. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (01-JUL-2016) Synthetic Systems & DNA Technologies, Synthetic Genomics, Inc., 11149 North Torrey Pines Rd., La Jolla, CA 92037, USA |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Weinstock,M.T. Fu,L. Schwartz,A.S. Brami,D. Gill,J. Gibson,D.G. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
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