| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000001593 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1, complete sequence） |
| 生物種名 | Acidiphilium multivorum AIU301 |
| アクセッション番号またはID | NC_015178 |
| コメント | Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NC_015178.1 |
| 登録日または更新日 | 2011-03-02 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 271573 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | AIU301 |
| 分離源 | |
| plasmid | pACMV1 |
| 備考 | strain coidentity: NBRC 100883 |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP012036.1.; ~~Please visit our web site.~URL:http://www.bio.nite.go.jp/~~DOGAN ; Database of Genomes Analyzed at NITE~The database contains genome sequence data, physical maps and the genomic and proteomic data of the microorganisms analyzed.~URL:http://www.bio.nite.go.jp/dogan/Top.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Genome Coverage :: 8x ; Sequencing Technology :: ABI3730 ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 12/13/2020 10:07:58 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.0 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,992 ; CDSs (total) :: 3,935 ; Genes (coding) :: 3,794 ; CDSs (with protein) :: 3,794 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 47 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 141 ; CDSs (without protein) :: 141 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 141 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 37 of 141 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 116 of 141 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 23 of 141 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 28 of 141 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Whole genome sequence of Acidiphilium multivorum AIU301 |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Narita-Yamada,S. Nakamura,S. Ito,N. Takarada,H. Katano,Y. Nakazawa,H. Hosoyama,A. Yamada,R. Fujita,N. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (28-DEC-2010) Contact:Director-General Department of Biotechnology National Institute of Technology and Evaluation, NITE Bioresource Information Center (NBIC), Department of Biotechnology; 2-49-10 Nishihara, Shibuya-ku, Tokyo 151-0066, Japan URL :http://www.bio.nite.go.jp/ |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Hosoyama,A. Yamada,R. Ito,N. Takarada,H. Narita-Yamada,S. Nakamura,S. Katano,Y. Ichikawa,N. Nakazawa,H. Fujita,N. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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