| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000001648
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-030, complete sequence）
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| 生物種名 |
Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12
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| アクセッション番号またはID |
NC_017114
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| コメント |
Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-030, complete sequence.
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| ゲノム配列のバージョン |
NC_017114.1
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| 登録日または更新日 |
2012-04-11
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
49961
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
IFO 3283
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| 分離源 |
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| plasmid |
pAPA12-030
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| 備考 |
strain coidentity: IFO 3283 = NBRC 3283
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP011173.1.; This work was done by Acetobacter pasteurianus genome sequencing consortium including Department of Microbiology and Immunology, Yamaguchi University School of Medicine, National Institute of Technology and Evaluation, Genetic Resources Technology, Faculty of Agriculture, Kyushu University, Department of Biological Chemistry, Faculty of Agriculture, Yamaguchi University and Mizkan Group Corporation Central Research Institute.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 08/15/2021 10:45:57 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.2 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,120 ; CDSs (total) :: 3,044 ; Genes (coding) :: 2,928 ; CDSs (with protein) :: 2,928 ; Genes (RNA) :: 76 ; rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 57 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 116 ; CDSs (without protein) :: 116 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 116 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 30 of 116 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 94 of 116 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 10 of 116 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 17 of 116 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length.
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Whole-genome analyses reveal genetic instability of Acetobacter pasteurianus
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| 雑誌名/登録機関名 |
Nucleic Acids Res 37 (17), 5768-5783 (2009)
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Azuma,Y. Hosoyama,A. Matsutani,M. Furuya,N. Horikawa,H. Harada,T. Hirakawa,H. Kuhara,S. Matsushita,K. Fujita,N. Shirai,M.
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| PubMed | |
| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (06-APR-2009) Contact:Yoshinao Azuma Yamaguchi University School of Medicine, Department of Microbiology and Immunology; Minami-Kogushi 1-1-1, Ube, Yamaguchi 755-8505, Japan URL :http://www.bio.nite.go.jp/dogan/Top
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Azuma,Y. Hosoyama,A.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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