解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000001699
データタイトル ゲノム(RefSeq:Aspergillus oryzae RIB40 DNA, chromosome 4)
生物種名 Aspergillus oryzae RIB40
アクセッション番号またはID NC_036438
コメント Aspergillus oryzae RIB40 DNA, chromosome 4.
ゲノム配列のバージョン NC_036438.1
登録日または更新日 2017-12-08
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配列長(bp)または配列数(rc) 4887096
形態 linear
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain RIB40
分離源
plasmid
備考
菌株へのコメント PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final NCBI review. The reference sequence is identical to BA000052.; This genome assembly has been updated so~as to reflect the location and orientation of~contigs on the chromosomes. Gap lengths were~estimated using the results from Optical~Mapping (http://www.bio.nite.go.jp/dogan/project/view/AO). This Aspergillus oryzae RIB40 genome consists of a nuclear genome assembly represented by eight chromosomes (assembled from 24 entries) and three unplaced contigs (AP007156, AP007160 and AP007177) and a complete mitochondrial genome (AP007176).; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Phred/Phrap software ; Assembly Name :: Aoryzae_assembly02 ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: INSDC submitter ; Annotation Status :: Full annotation ; Annotation Pipeline :: Eukaryotic Annotation Propagation Pipeline ; ##Genome-Annotation-Data-END##
参照 1
  タイトル Genome sequencing and analysis of Aspergillus oryzae
  雑誌名/登録機関名 Nature 438 (7071), 1157-1161 (2005)
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Machida,M. Asai,K. Sano,M. Tanaka,T. Kumagai,T. Terai,G. Kusumoto,K. Arima,T. Akita,O. Kashiwagi,Y. Abe,K. Gomi,K. Horiuchi,H. Kitamoto,K. Kobayashi,T. Takeuchi,M. Denning,D.W. Galagan,J.E. Nierman,W.C. Yu,J. Archer,D.B. Bennett,J.W. Bhatnagar,D. Cleveland,T.E. Fedorova,N.D. Gotoh,O. Horikawa,H. Hosoyama,A. Ichinomiya,M. Igarashi,R. Iwashita,K. Juvvadi,P.R. Kato,M. Kato,Y. Kin,T. Kokubun,A. Maeda,H. Maeyama,N. Maruyama,J. Nagasaki,H. Nakajima,T. Oda,K. Okada,K. Paulsen,I. Sakamoto,K. Sawano,T. Takahashi,M. Takase,K. Terabayashi,Y. Wortman,J.R. Yamada,O. Yamagata,Y. Anazawa,H. Hata,Y. Koide,Y. Komori,T. Koyama,Y. Minetoki,T. Suharnan,S. Tanaka,A. Isono,K. Kuhara,S. Ogasawara,N. Kikuchi,H.
  PubMed
参照 2
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (04-APR-2018) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者
  PubMed
参照 3
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (03-JUN-2011) Contact:Masayuki Machida National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Bioproduction Research Institute; Higashi 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8566, Japan
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Fujita,N. Sawano,T. Yamada,O. Tanaka,T. Machida,M.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

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7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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