データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名(著者名含) | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株(変異株の場合) | 付加情報 |
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データID | ANGE0000000001699 |
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データタイトル | ゲノム(RefSeq:Aspergillus oryzae RIB40 DNA, chromosome 4) |
生物種名 | Aspergillus oryzae RIB40 |
アクセッション番号またはID | NC_036438 |
コメント | Aspergillus oryzae RIB40 DNA, chromosome 4. |
ゲノム配列のバージョン | NC_036438.1 |
登録日または更新日 | 2017-12-08 |
配列取得用URL | |
配列ファイルダウンロード | |
CDSファイルダウンロード | |
配列長(bp)または配列数(rc) | 4887096 |
形態 | linear |
BioProject | |
BioSample | |
配列の種類 | genomic DNA |
strain | RIB40 |
分離源 | |
plasmid | |
備考 | |
菌株へのコメント | PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final NCBI review. The reference sequence is identical to BA000052.; This genome assembly has been updated so~as to reflect the location and orientation of~contigs on the chromosomes. Gap lengths were~estimated using the results from Optical~Mapping (http://www.bio.nite.go.jp/dogan/project/view/AO). This Aspergillus oryzae RIB40 genome consists of a nuclear genome assembly represented by eight chromosomes (assembled from 24 entries) and three unplaced contigs (AP007156, AP007160 and AP007177) and a complete mitochondrial genome (AP007176).; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Phred/Phrap software ; Assembly Name :: Aoryzae_assembly02 ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: INSDC submitter ; Annotation Status :: Full annotation ; Annotation Pipeline :: Eukaryotic Annotation Propagation Pipeline ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
参照 | 1 |
タイトル | Genome sequencing and analysis of Aspergillus oryzae |
雑誌名/登録機関名 | Nature 438 (7071), 1157-1161 (2005) |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | Machida,M. Asai,K. Sano,M. Tanaka,T. Kumagai,T. Terai,G. Kusumoto,K. Arima,T. Akita,O. Kashiwagi,Y. Abe,K. Gomi,K. Horiuchi,H. Kitamoto,K. Kobayashi,T. Takeuchi,M. Denning,D.W. Galagan,J.E. Nierman,W.C. Yu,J. Archer,D.B. Bennett,J.W. Bhatnagar,D. Cleveland,T.E. Fedorova,N.D. Gotoh,O. Horikawa,H. Hosoyama,A. Ichinomiya,M. Igarashi,R. Iwashita,K. Juvvadi,P.R. Kato,M. Kato,Y. Kin,T. Kokubun,A. Maeda,H. Maeyama,N. Maruyama,J. Nagasaki,H. Nakajima,T. Oda,K. Okada,K. Paulsen,I. Sakamoto,K. Sawano,T. Takahashi,M. Takase,K. Terabayashi,Y. Wortman,J.R. Yamada,O. Yamagata,Y. Anazawa,H. Hata,Y. Koide,Y. Komori,T. Koyama,Y. Minetoki,T. Suharnan,S. Tanaka,A. Isono,K. Kuhara,S. Ogasawara,N. Kikuchi,H. |
PubMed | |
参照 | 2 |
タイトル | Direct Submission |
雑誌名/登録機関名 | Submitted (04-APR-2018) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | |
PubMed | |
参照 | 3 |
タイトル | Direct Submission |
雑誌名/登録機関名 | Submitted (03-JUN-2011) Contact:Masayuki Machida National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Bioproduction Research Institute; Higashi 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8566, Japan |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | Fujita,N. Sawano,T. Yamada,O. Tanaka,T. Machida,M. |
PubMed | |
関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
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7.コレクション情報
8.提供機関情報
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10.プロジェクト情報
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