| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000002321 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Swingsia samuiensis strain AH83 plasmid unnamed1, complete sequence） |
| 生物種名 | Swingsia samuiensis |
| アクセッション番号またはID | CP038142 |
| コメント | Swingsia samuiensis strain AH83 plasmid unnamed1, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | CP038142.1 |
| 登録日または更新日 | 2019-07-02 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 30193 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | AH83 |
| 分離源 | Plant |
| plasmid | unnamed1 |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | Bacteria and source DNA available from NBRC.; Annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (released 2013). Information about the Pipeline can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 19-MAR-2019 ; Assembly Method :: HGAP v. 4 ; Assembly Name :: Swingsia_samuiensis ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 625.0x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 03/21/2019 13:37:38 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 4.8 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 2,097 ; CDSs (total) :: 2,019 ; Genes (coding) :: 1,987 ; CDSs (with protein) :: 1,987 ; Genes (RNA) :: 78 ; rRNAs :: 6, 6, 6 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 6, 6, 6 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 56 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 32 ; CDSs (without protein) :: 32 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 32 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 16 of 32 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 17 of 32 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 8 of 32 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 8 of 32 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | The complete genome sequence of Swingsia samuiensis NBRC107927(T) |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chua,K.-O. Chan,K.-G. See-Too,W.-S. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (20-MAR-2019) Institute of Biological Sciences, University of Malaya, University of Malaya, Kuala Lumpur, Kuala Lumpur 50603, Malaysia |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chua,K.-O. Chan,K.-G. See-Too,W.-S. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
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