| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000002375 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Bacteroides uniformis strain NBRC 113350 plasmid pBUN4, complete sequence） |
| 生物種名 | Bacteroides uniformis |
| アクセッション番号またはID | NZ_AP019728 |
| コメント | Bacteroides uniformis strain NBRC 113350 plasmid pBUN4, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_AP019728.1 |
| 登録日または更新日 | 2019-07-12 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 4306 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 113350 |
| 分離源 | |
| plasmid | pBUN4 |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP019728.1.; Annotated at DFAST https://dfast.nig.ac.jp/~~; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: canu v. 1.7.1; Unicycler v. 0.4.4 ; Genome Coverage :: 140x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq; PacBio SMRT ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 12/15/2020 04:55:03 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.0 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 4,163 ; CDSs (total) :: 4,084 ; Genes (coding) :: 3,993 ; CDSs (with protein) :: 3,993 ; Genes (RNA) :: 79 ; rRNAs :: 4, 4, 4 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 4, 4, 4 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 64 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 91 ; CDSs (without protein) :: 91 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 91 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 40 of 91 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 49 of 91 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 18 of 91 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 15 of 91 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Complete genome sequence of Bacteroides uniformis NBRC 113350 |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Miura,T. Furukawa,M. Shimamura,M. Ohyama,Y. Yamazoe,A. Kawasaki,H. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (10-JUN-2019) Contact:Director-General Biological Resource Center National Institute of Technology and Evaluation, Biological Resource Center, NBRC; 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu, Chiba 292-0818, Japan URL :https://www.nite.go.jp/en/nbrc/ |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Miura,T. Furukawa,M. Shimamura,M. Ohyama,Y. Yamazoe,A. Kawasaki,H. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
Not found
7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
Not found
10.プロジェクト情報
Not found
