| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000002684 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Croceicoccus naphthovorans strain PQ-2 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Croceicoccus naphthovorans |
| アクセッション番号またはID | NZ_CP011770 |
| コメント | Croceicoccus naphthovorans strain PQ-2 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CP011770.1 |
| 登録日または更新日 | 2015-06-18 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3543806 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | PQ-2 |
| 分離源 | sterile tools |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP011770.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; This genome has a base modification file available.; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: HGAP v. 2.2.0 ; Genome Coverage :: 100 ; Sequencing Technology :: PacBio RS II ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 07/24/2021 01:42:21 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.2 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,860 ; CDSs (total) :: 3,809 ; Genes (coding) :: 3,702 ; CDSs (with protein) :: 3,702 ; Genes (RNA) :: 51 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 45 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 107 ; CDSs (without protein) :: 107 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 107 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 53 of 107 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 48 of 107 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 19 of 107 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 107 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (05-JUN-2015) Environmental Science, Zhejiang University, 688 Yu Hang Tang Road, Hangzhou, Zhejiang 310058, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Zeng,Y. Huang,Y. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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