| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000002947 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Limosilactobacillus portuensis strain P5L02, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Limosilactobacillus portuensis |
| アクセッション番号またはID | JAHPJJ000000000 |
| コメント | Limosilactobacillus portuensis strain P5L02, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | JAHPJJ000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2021-06-27 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 43 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | P5L02 |
| 分離源 | vaginal swabs |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The Limosilactobacillus portuensis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAHPJJ000000000. This version of the project (01) has the accession number JAHPJJ010000000, and consists of sequences JAHPJJ010000001-JAHPJJ010000043.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from BCRC 81307 and NBRC 115099.; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.10.1 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 298.0x ; Sequencing Technology :: Illumina NovaSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 06/22/2021 10:06:19 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.2 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 2,013 ; CDSs (total) :: 1,954 ; Genes (coding) :: 1,898 ; CDSs (with protein) :: 1,898 ; Genes (RNA) :: 59 ; rRNAs :: 1, 2, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1 (5S, 23S) ; partial rRNAs :: 2 (16S) ; tRNAs :: 51 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 56 ; CDSs (without protein) :: 56 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 56 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 56 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 21 of 56 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 13 of 56 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 2 of 56 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Limosilactobacillus angelus sp. nov., isolated from the human vagina |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,Y.-S. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (19-JUN-2021) Department of Biotechnology, Ming Chuan University, De-Ming Rd., Guishan Dist., Taoyuan City 333, Taiwan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,Y.-S. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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