| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000003116 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Parageobacillus toebii NBRC 107807 strain DSM 14590 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Parageobacillus toebii NBRC 107807 |
| アクセッション番号またはID | NZ_CP049703 |
| コメント | Parageobacillus toebii NBRC 107807 strain DSM 14590 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CP049703.1 |
| 登録日または更新日 | 2020-04-01 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3270071 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | DSM 14590 |
| 分離源 | |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP049703.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: HGAP v. smrtanalysis v. 2.3.0_p5, HGAP 3 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 185.0x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 04/01/2021 03:01:05 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.1 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,414 ; CDSs (total) :: 3,292 ; Genes (coding) :: 3,076 ; CDSs (with protein) :: 3,076 ; Genes (RNA) :: 122 ; rRNAs :: 8, 10, 10 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 8, 10, 10 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 89 ; ncRNAs :: 5 ; Pseudo Genes (total) :: 216 ; CDSs (without protein) :: 216 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 216 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 116 of 216 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 110 of 216 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 36 of 216 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 42 of 216 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Complete genome sequence of Parageobacillus toebii DSM 14590 |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Hatmaker,E.A. O'Dell,K.B. Riley,L.A. Payne,I.C. Guss,A.M. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (28-FEB-2020) BioSciences Division, Oak Ridge National Laboratory, P.O. Box 2008, Oak Ridge, TN 37831, USA |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Hatmaker,E.A. Guss,A.M. Shapiro,N. Huntemann,M. Clum,A. Pillay,M. Palaniappan,K. Varghese,N. Mikhailova,N. Stamatis,D. Reddy,T. Woyke,T. |
| PubMed | |
| 参照 | 3 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (16-OCT-2018) Prokaryotic Super Group, DOE Joint Genome Institute, 2800 Mitchell Drive, Walnut Creek, CA 94598, USA |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Guss,A. Huntemann,M. Clum,A. Pillay,M. Palaniappan,K. Varghese,N. Mikhailova,N. Stamatis,D. Reddy,T. Daum,C. Shapiro,N. Ivanova,N. Kyrpides,N. Woyke,T. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
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7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
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10.プロジェクト情報
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