データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名(著者名含) | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株(変異株の場合) | 付加情報 |
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データID | ANGE0000000003362 |
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データタイトル | ゲノム(Blautia sp. NBRC 113351 chromosome, complete genome) |
生物種名 | Blautia sp. NBRC 113351 |
アクセッション番号またはID | CP084061 |
コメント | Blautia sp. NBRC 113351 chromosome, complete genome. |
ゲノム配列のバージョン | CP084061.1 |
登録日または更新日 | 2021-10-02 |
配列取得用URL | |
配列ファイルダウンロード | |
CDSファイルダウンロード | |
配列長(bp)または配列数(rc) | 6247046 |
形態 | circular |
BioProject | |
BioSample | |
配列の種類 | genomic DNA |
strain | NBRC 113351 |
分離源 | faecal matter |
plasmid | |
備考 | |
菌株へのコメント | The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Unicycler v. v0.4.7 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 200x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore GridION; Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 09/24/2021 13:34:17 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.3 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 5,638 ; CDSs (total) :: 5,554 ; Genes (coding) :: 5,458 ; CDSs (with protein) :: 5,458 ; Genes (RNA) :: 84 ; rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 65 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 96 ; CDSs (without protein) :: 96 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 96 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 23 of 96 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 72 of 96 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 14 of 96 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 96 ; CRISPR Arrays :: 4 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
参照 | 1 |
タイトル | Blautia puncti sp. nov., isolated from Japanese fecal |
雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | Shimamura,M. Yamazoe,A. Miura,T. Kawasaki,H. |
PubMed | |
参照 | 2 |
タイトル | Direct Submission |
雑誌名/登録機関名 | Submitted (21-SEP-2021) Biotechnology center, Biological Resource Center, National Institute of Technology and Evaluation (NBRC), 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu, Chiba 292-0818, Japan |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | Miura,T. Shimamura,M. Furukawa,M. Ohyama,Y. Kawasaki,H. |
PubMed | |
関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
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