| データID |
ANGE0000000003362
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| データタイトル |
ゲノム（Blautia sp. NBRC 113351 chromosome, complete genome）
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| 生物種名 |
Blautia sp. NBRC 113351
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| アクセッション番号またはID |
CP084061
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| コメント |
Blautia sp. NBRC 113351 chromosome, complete genome.
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| ゲノム配列のバージョン |
CP084061.1
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| 登録日または更新日 |
2021-10-02
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| 配列取得用URL |
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| 配列ファイルダウンロード |
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| CDSファイルダウンロード |
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| 配列長（bp）または配列数（rc） |
6247046
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| 形態 |
circular
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| BioProject |
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| BioSample |
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| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
NBRC 113351
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| 分離源 |
faecal matter
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Unicycler v. v0.4.7 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 200x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore GridION; Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 09/24/2021 13:34:17 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.3 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 5,638 ; CDSs (total) :: 5,554 ; Genes (coding) :: 5,458 ; CDSs (with protein) :: 5,458 ; Genes (RNA) :: 84 ; rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 65 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 96 ; CDSs (without protein) :: 96 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 96 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 23 of 96 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 72 of 96 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 14 of 96 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 96 ; CRISPR Arrays :: 4 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Blautia puncti sp. nov., isolated from Japanese fecal
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Shimamura,M. Yamazoe,A. Miura,T. Kawasaki,H.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (21-SEP-2021) Biotechnology center, Biological Resource Center, National Institute of Technology and Evaluation (NBRC), 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu, Chiba 292-0818, Japan
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Miura,T. Shimamura,M. Furukawa,M. Ohyama,Y. Kawasaki,H.
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| PubMed |
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