解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000003362
データタイトル ゲノム(Blautia sp. NBRC 113351 chromosome, complete genome)
生物種名 Blautia sp. NBRC 113351
アクセッション番号またはID CP084061
コメント Blautia sp. NBRC 113351 chromosome, complete genome.
ゲノム配列のバージョン CP084061.1
登録日または更新日 2021-10-02
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc) 6247046
形態 circular
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain NBRC 113351
分離源 faecal matter
plasmid
備考
菌株へのコメント The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Unicycler v. v0.4.7 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 200x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore GridION; Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 09/24/2021 13:34:17 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.3 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 5,638 ; CDSs (total) :: 5,554 ; Genes (coding) :: 5,458 ; CDSs (with protein) :: 5,458 ; Genes (RNA) :: 84 ; rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 65 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 96 ; CDSs (without protein) :: 96 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 96 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 23 of 96 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 72 of 96 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 14 of 96 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 96 ; CRISPR Arrays :: 4 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
参照 1
  タイトル Blautia puncti sp. nov., isolated from Japanese fecal
  雑誌名/登録機関名 Unpublished
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Shimamura,M. Yamazoe,A. Miura,T. Kawasaki,H.
  PubMed
参照 2
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (21-SEP-2021) Biotechnology center, Biological Resource Center, National Institute of Technology and Evaluation (NBRC), 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu, Chiba 292-0818, Japan
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Miura,T. Shimamura,M. Furukawa,M. Ohyama,Y. Kawasaki,H.
  PubMed

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