| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000003701 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Tetragenococcus halophilus subsp. flandriensis strain NBRC 114546, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Tetragenococcus halophilus subsp. flandriensis |
| アクセッション番号またはID | BSUG00000000 |
| コメント | Tetragenococcus halophilus subsp. flandriensis strain NBRC 114546, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | BSUG00000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-03-24 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| CDSファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 89 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 114546 |
| 分離源 | Degraded sugar thick juice |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The Tetragenococcus halophilus subsp. flandriensis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession BSUG00000000. This version of the project (01) has the accession number BSUG01000000, and consists of sequences BSUG01000001-BSUG01000089.; Genome sequencing and analysis were conducted under the Global Catalogue of Microorganisms (GCM) 10K type strain sequencing project (http://gctype.wdcm.org). The genomic data are also available at http://gctype.wdcm.org/sequencing/GCM10025886 ~~Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SOAPdenovo v. 2.04; SPAdes v. 3.13.0; Velvet v. 1.2.10; Platanus-b v. 1.2.0 ; Genome Coverage :: 106x ; Sequencing Technology :: BGISEQ ; ##Genome-Assembly-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | The Global Catalogue of Microorganisms (GCM) 10K type strain sequencing project: providing services to taxonomists for standard genome sequencing and annotation |
| 雑誌名/登録機関名 | Int J Syst Evol Microbiol 69 (4), 895-898 (2019) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Wu,L. Ma,J. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (24-FEB-2023) Contact:Qinglan Sun Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, WFCC-MIRCEN World Data Centre for Microorganisms; NO.1 Beichen West Road, Chaoyang Disct, Beijing 100101, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Sun,Q. Mori,K. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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